第13回日本アカデミー賞は1990年（平成2年）2月23日に行われた日本アカデミー賞の発表・授賞式。

東京プリンスホテルで開催され、司会は西田敏行と島田陽子が務めた。
最優秀作品賞

黒い雨

優秀作品賞

あ・うん

社葬

本覺坊遺文 千利休

利休

最優秀監督賞

今村昌平（黒い雨）

優秀監督賞

熊井啓（本學坊遺文 千利休）　

勅使河原宏（利休）　

降旗康男（あ・うん、極道の妻たち 三代目姐、将軍家光の乱心 激突）　

舛田利雄（社葬）

最優秀脚本賞

石堂淑朗・今村昌平（黒い雨）

優秀脚本賞

赤瀬川原平・勅使河原宏（利休）　

中村努（あ・うん）　

松田寛夫（社葬）

依田義賢（本學坊遺文 千利休）

最優秀主演男優賞

三國連太郎（釣りバカ日誌、利休）

優秀主演男優賞

緒形拳（社葬、将軍家光の乱心 激突）

奥田瑛二（本學坊遺文 千利休）　

高倉健（あ・うん）　

ビートたけし（その男、凶暴につき）

最優秀主演女優賞

田中好子（黒い雨）

優秀主演女優賞

古手川祐子（花の降る午後）　

十朱幸代（社葬、ハラスのいた日々）　

富司純子（あ・うん）

三田佳子（男はつらいよ 寅次郎サラダ記念日、極道の妻たち 三代目姐、利休）

最優秀助演男優賞

板東英二（あ・うん）

優秀助演男優賞

江守徹（社葬）　

橋爪功（キッチン、ジュリエット・ゲーム、善人の条件）　

山�ｱ努（ハリマオ、舞姫、利休）

萬屋錦之介（本學坊遺文 千利休）

最優秀助演女優賞

市原悦子（黒い雨）

優秀助演女優賞

桜田淳子（花の降る午後）

富田靖子（あ・うん）

宮本信子（あ・うん）

吉田日出子（社葬）　

最優秀音楽賞

武満徹（黒い雨、利休）

優秀音楽賞

朝川朋之（あ・うん）　

宇崎竜童（社葬）　

長渕剛（オルゴール）　

松村禎三（本學坊遺文 千利休）　

最優秀撮影賞

川又昂（黒い雨）

優秀撮影賞

木村大作（あ・うん、極道の妻たち 三代目姐）　

仙元誠三（愛と平成の色男、オルゴール、キッチン、ジュリエット・ゲーム ）　

栃沢正夫（本學坊遺文 千利休）　

森田富士郎（226、利休）

最優秀照明賞

岩木保夫（黒い雨）

優秀照明賞

増田悦章（あ・うん、極道の妻たち 三代目姐）　

渡辺三雄（愛と平成の色男、オルゴール、キッチン、ジュリエット・ゲーム）

岩木保夫（本學坊遺文 千利休）

中岡源権（226、利休） 　

最優秀美術賞

西岡善信・重田重盛（利休）