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この項目では、植物の種子（しゅし）について説明しています。
仏教の唯識思想における種子（しゅうじ、しゅじ）については「種子 (唯識)」をご覧ください。
密教において諸仏を梵字1?2文字で象徴的に表したものを指す種子（しゅじ）については「種子 (密教)」をご覧ください。
女優の種子については「種子 (女優)」をご覧ください。
オオトウワタの種子
種子（しゅし）とは、種子植物で有性生殖によって形成される散布体である。一般には、単に種（たね）と呼ばれることが多い。
種子は親植物の組織起源の種皮（しゅひ）という皮に包まれ、その中には受精卵から発育した幼い植物体、すなわち胚が入っている。種子はめしべにある胚珠から発達する。花のつくりの場合は、子房は柱頭の下などに多い。被子植物の場合、種子は子房に包まれていて、これが後に果実となる。裸子植物の場合は、めしべの表面に乗っている。
農業上繁殖に用いられるものは、厳密には種子でなくとも種もみや種芋と呼ばれ、さらに動物（家畜）についても種馬と表現されることがある。 たとえば、豆は様々なマメ科植物の種子である。これを例に説明する。 このように、種子の中には、既にこれから発芽する苗が含まれている。 カキの種子では、中の様子がかなり異なっている。種子を半分に切ると、幼い植物体は種子に比べてずっと小さく、種皮の中には半透明の固いものが詰まっている。これは胚乳と呼ばれ、胚嚢
種子の構造
豆は、普通、細長い鞘の中にいくつか並んで収まっている（ ⇒アメリカデイゴの豆果）。この鞘は、めしべの基部、子房が膨らんだものである。子房は胚珠を中に収め、胚珠が種子に発達してもそれを包んでいる。子房に由来する構造を果実という。
個々の豆の表面は、薄い皮に包まれている。この皮を種皮（しゅひ）と呼ぶ。種皮は珠皮に由来する。
種皮をはがすと、中には大きく2つに割れる部分がある。半球形の2つの部分は、小さな出っ張りの部分でつながり、その間には小さな折り重なったような構造がみられる。半球形の部分は子葉（しよう）と呼ばれ、発芽すると双葉（ふたば）として地上に姿を現す（種子内に留まるものもある）。丸く膨らんでいるのは、栄養が蓄えられているからである。
子葉をつなぐ出っ張りは、胚軸（はいじく）と呼ばれ、芽生えた苗の茎になる部分である。胚軸に続く部分（子葉と反対側）が根となる幼根である。間に挟まった折り重なったものは、双葉の次の本葉が既に形成されているのが見えているものである。
胚珠であったときに栄養分を得ていた珠柄のついていた痕跡はへそと呼ばれ、哺乳類が胎児時代にへその緒を通して栄養分を得ていたところから機能的に見ても、まさにへそと呼ぶにふさわしい。種子発芽時の吸水は主としてへそを通して行われる。
双子葉植物の種子の断面模式図。a:種皮 - b:胚乳 - c:子葉 - d:胚軸
基本的に被子植物の種子は、カキの例のように、発生の出発点において極核を含む中央細胞と精細胞が受精した3倍体核に由来する胚乳を生じるが、マメ科など一部の植物では二次的に胚乳が退化し、かわりに子葉などに発芽のための栄養分を蓄える。ほかに、ラン科（ ⇒エビネの種子）など若干の植物で、発芽のための蓄えを持たず、菌類との共生に依存するなどして発芽する例がある。裸子植物の胚乳は1倍体の雌性配偶体自体に由来し、シダ植物の前葉体と相同の器官で、被子植物の胚乳とは異質な面がある。
多くの種子は、幼植物が発芽するための栄養分を子葉か胚乳に蓄えているため、動物から見れば魅力的な食料である。人間の食物の中にも種子はさまざまに用いられ、特にマメ科やイネ科のものは、しばしば主食の位置を占める。主食に使われるイネ科の種子を穀物と呼ぶ。蓄えられる栄養分は、デンプンか油脂の形である場合が多い。
種子の散布詳細は「en:Biological dispersal」を参照
植物には基本的に移動能力がない。ある場所で種子が発芽をすれば、そこに一生とどまるのが基本である。従って、種子が好適な場所に到達する何らかの手段がなければならない。現に親植物が生息している以上、親の根元は好適地であるから、親が自分の根元に種子を落とすのは一つの方法だが、それでは親子あるいは子供同士で無意味な競争をせねばならない。また分布拡大の意味からも、種子はある程度以上、遠くに運ばれる必要がある。
実際には、種子にも移動能力はないので、種子散布（英語版）は何か外の力に頼らざるを得ない。そのためそれぞれの植物は、何かに頼って種子を散布するための方法を発達させてきた。サトウカエデの種子
風による散布
物理的な力に頼るものとしては、よく見られるものの一つである。裸子植物のクロマツやアカマツでは、種子の一端が薄い膜状に伸びており、空中にでると風を受けて、回転しながら飛んでゆく。同じような構造を発達させたものに、カエデ科のもの（モミジの仲間）やアオギリなどの果実がある。同じ風を利用するにも、キク科のタンポポ（ ⇒セイヨウタンポポの痩果）などは、果実の一端から多数の毛を生じて、これが風を捉える方法を取っている。同様なものは、キョウチクトウ科（旧分類ではガガイモ科）のガガイモの種子、イネ科のススキの果実など、多くのものに見られる。
水による散布
水はものを運ぶ力が強く、特別な適応がなくても勝手に運んでくれるので、多くの種がその恩恵をこうむっていると思われる。特に、水による運搬への適応を示しているので有名なものにラッカセイ（落花生・ピーナッツ）がある。豆の鞘が空気を含み、水に運ばれやすくなっている。スゲの仲間の果実は後述のアリによる種子散布に適応したものと水による種子散布に適応したものの2つに大別される。
海流による散布
海岸性のごく限られた植物に見られる。陸上植物には海水が有害なので、まず塩分に耐えられる事が前提になる。ハマユウやマングローブの胎生種子や、ゴバンノアシなど、熱帯の海岸性植物には、大きく膨らみ海水に浮かぶ果実や種子をつけるものがあり、これらは海流による散布に適応したものである。ココヤシの果実は遠い海岸に流れつくことで有名である。
動物による散布
これにはいくつかの型がある。
餌となることによる散布を目指すものは、種子や果実が動物の食料として選ばれ、この時に散布の手助けをしてもらうことを期待する。
