秋田県の二級水系一覧では、秋田県を流れる水系のうち、秋田県が管理する二級水系を記述する。2008年現在、21水系、51河川ある[1]。

リストの順序は、北から南に、河口の位置を基準にして並んでいる。地形順の参考として一級水系（国土交通省管轄）も記載している。括弧内の水系名が一級水系。

水系名河川延長(km)流域面積(km2)河川数河口所在地備考
真瀬川6.0001八峰町
水沢川13.3201八峰町
塙川15.3901八峰町
竹生川12.8001八峰町、能代市
（米代川）110.18184能代市一級水系
鮪川川2.4801男鹿市
滝川7.4001男鹿市
賀茂川4.5023男鹿市
比詰川3.4001男鹿市
馬場目川47.51823
（雄物川）129.8173秋田市一級水系
下浜鮎川7.5001秋田市
勝手川3.9001由利本荘市
君ヶ野川7.4001由利本荘市
二古川3.8001由利本荘市
衣川13.0001由利本荘市
（子吉川）60.80045由利本荘市一級水系
西目川8.1821由利本荘市
大沢川7.5001にかほ市
白雪川20.1821にかほ市
赤石川8.4501にかほ市
象潟川3.6001にかほ市
奈曽川12.2182にかほ市
十和田湖10.2551

出典・参考文献

⇒河川表（秋田県河川砂防課）

脚注^ 十和田湖を含む

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