独立教会(どくりつきょうかい)は、独立しているキリスト教の教会組織を指して用いられる日本語であるが、どのように独立していることを指すのかについては正教会、カトリック教会、プロテスタント教会で異なっている(「独立」が指揮・報告系統のことなのか、資金的なことなのか、地位なのか、教義や典礼の内容なのか、ということが結果として異なっている)。また、他言語では違う語彙が用いられることが多い。
独立正教会(英語: Autocephalous Church) - 正教会における教会組織の地位。独立教会とも。
独立カトリック教会(英語: Independent Catholic Churches) - ローマ教皇座との一致に無いカトリック教会(ローマ教皇側は承認せず)。
フィリピン独立教会 (w:Philippine Independent Church