次に生薬の一覧を示す。

なお、生薬には医薬品医療機器等法上、医薬品として扱われるものと、医薬品として扱われないもの（食品扱い）の 2種類がある。本記事においては、これら両方が混在している。医薬品と食品の区分については、医薬品#食薬区分を参照されたい。
生薬等一覧

生薬名漢名生薬ラテン名局方基原基原学名科備考
アカメガシワ赤芽柏Malloti Cortex局18アカメガシワMallotus japonicus (L.f.) Mull.Arg.Euphorbiaceae
アカメガシワ将軍木皮Malloti Cortex局18アカメガシワMallotus japonicus (L.f.) Mull.Arg.Euphorbiaceae
アガリクス姫松茸Agaricus局外18ニセモリノカサAgaricus subrufescens PeckAgaricaceae
アギ阿魏Ferulae Resina薬典20アギFerula assa-foetida L.Umbelliferae
アキョウ阿膠Asini Corii Collas局外18,

薬典20ロバEquus asinus Linnaeus, 1758Equidae
アシタバ明日葉Herba Angelicae keiskei局外18アシタバAngelica keiskei (Miq.) Koidz.Apiaceae
アセンヤク阿仙薬Gambir局18アセンヤクUncaria gambir (W.Hunter) Roxb.Rubiaceae
ガンビール阿仙薬Gambir局18アセンヤクUncaria gambir (W.Hunter) Roxb.Rubiaceae阿仙薬に同じ
アセンヤク末阿仙薬末Gambir pulveratum局18アセンヤクUncaria gambir (W.Hunter) Roxb.Rubiaceae
アタンシ（中国語版、英語版）鴉胆子Bruceae Fructus局外18アタンシBrucea javanica

(L.) Merr.Simaroubaceae
アヘン阿片Opium局ケシPapaver somniferum L.Papaveraceae
アヘンまつ阿片末Opium pulveratum局18ケシPapaver somniferum L.Papaveraceae
アヘン散阿片散局18ケシPapaver somniferum L.Papaveraceae
アヘンチンキTinctura Opii局18ケシPapaver somniferum L.Papaveraceae
アヘン・トコン散局18
アマチャ甘茶Hydrangeae Dulcis Folium局18アマチャHydrangea macrophylla subsp. serrata (Thunb.) MakinoSaxifragaceaeアジサイH. macrophyllaの亜種
アマチャ末甘茶末Hydrangeae Dulcis Folium pulveratum局18アマチャHydrangea macrophylla subsp. serrata (Thunb.) MakinoSaxifragaceaeアジサイH. macrophyllaの亜種
アマチャヅル

(甘茶蔓)絞股藍Herba Gynostemmatis局外18アマチャヅルGynostemma pentaphyllum (Thunb.) MakinoCucurbitaceae
アマチャヅル

(甘茶蔓)七葉胆Herba Gynostemmatis局外18アマチャヅルGynostemma pentaphyllum (Thunb.) MakinoCucurbitaceae
アラビアゴムGummi Arabicum局18アラビアゴムcf. Senegalia senegal (L.) Britton (1930)FabaceaeAcacia senegal (L.) Willd. (1806)または同属植物（局18）
アラビアゴム末Gummi Arabicum pulveratum局18アラビアゴムcf. Senegalia senegal (L.) Britton (1930)FabaceaeAcacia senegal (L.) Willd. (1806)または同属植物（局18）
アロエ蘆薈Aloe局18ロカイAloe ferox Mill. vel A. ferox × africana

Mill. vel A. ferox × spicata L.f. etc.Asphodelaceae
アロエ末蘆薈末Aloe pulverata局18ロカイAloe ferox Mill. vel A. ferox × africana

Mill. vel A. ferox × spicata L.f. etc.Asphodelaceae
アンソッコウ安息香Benzonium局18アンソクコウノキStyrax benzoin Dryand.Styracaceae
イタカッコン（中国語版、ドイツ語版）板葛根  板藍根とも

或いは葛根
イチイヨウ一位葉Folium Taxi cuspidatae局外18イチイTaxus cuspidata

Siebold & Zucc.Taxaceae
イチジク無花果Fructus Fici局外18イチジクFicus carica L.Moraceae
イチョウ葉銀杏葉Ginkgonis Folium局外18イチョウGinkgo biloba L.Ginkgoaceae
ギンナン銀杏Ginkgonis Semen局外18イチョウGinkgo biloba L.Ginkgoaceae
ハッカ白果Ginkgonis Semen局外18イチョウGinkgo biloba L.Ginkgoaceae
イレイセン（中国語版）威霊仙Clematidis Radix局18サキシマボタ

ンヅルなどClematis mandshurica Ruprecht，C.chinensis Osbeck vel C. hexapetala Pall.Ranunculaceae
イワタバコ岩煙草Conandri Herba局外18イワタバコConandron ramondioides Siebold et Zucc.Gesneriaceaeイワヂシャ、ガンワキョに同じ
イワヂシャ岩萵苣Conandri Herba局外18イワタバコConandron ramondioides Siebold et Zucc.Gesneriaceaeイワタバコ、ガンワキョに同じ