医薬品における殺菌剤（さっきんざい、英: anti-bacterial）とは、病原性を有する微生物を殺す、または増殖を抑止するための薬剤。殺菌薬とも。

ただし、抗生物質や抗真菌薬を除外し、微生物を非選択的に殺すものを呼ぶのが普通である。また医療機器の殺菌のみ、あるいは外用（皮膚）にのみ用いるものは消毒薬ということが多い。

例として以下のようなものがある。

ヨウ素剤 - ヨードチンキ、ポビドンヨード

塩素類 - 次亜塩素酸ナトリウム、次亜塩素酸カルシウム（さらし粉）

マーキュロクロム液（赤チン）

グルコン酸クロルヘキシジン

アクリノール

アルコール類 - エタノール、2-プロパノール（イソプロパノール、イソプロピルアルコール）

過酸化水素水（オキシドール）

逆性石鹸 - 塩化ベンザルコニウム、塩化セチルピリジニウムなど

フェノール類 - クレゾール石鹸液など

関連項目

殺菌

抗炎症薬

抗真菌薬