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杉本氏（すぎもとし）は日本の氏族のひとつ。全国的に見られる姓であるが、山城、河内、加賀、越中、越後、信濃、相模、美作などに多い。
清和源氏源為義流

本姓は源氏。家系は清和天皇の血をひく清和源氏のひとつ河内源氏の流れ。源為義の庶子為国より発する。家紋は蔦。
桓武平氏三浦氏流

本姓は平氏。家系は桓武天皇の流れを汲む桓武平氏の平良文を祖とする三浦氏の庶流である。三浦義明の長男義宗が起源で鎌倉の杉本城（現在の杉本寺）を拠点としたことから杉本（椙本とも）を称した。杉本氏からは、初代鎌倉幕府侍所別当和田義盛にはじまる和田氏が別れた他、杉浦氏、鮎川氏、走水氏などの庶流が別れた。

また、義宗の弟で三浦本宗家を相続した義澄の次男佐原義連の家系からも杉本氏が別れ、義連の子横須賀時連に宗明という子がおり、以後杉本氏として存続した。

宗明（下野守）?時明（安芸守）?貞連（因幡守）?貞清?駒石丸?久連?連秀?義清?義定

と続いた。

なお、宗明の次男貞宗が三浦姓に復して美作三浦氏を起こし戦国大名として栄えた。
藤原氏上杉氏流

勧修寺家の傍流越後守護上杉氏の庶家に杉本氏がある。
伊予橘氏楠木氏流

また、楠木正成の一族にも杉本氏が確認される。本姓は伊予橘氏（越智氏の一族）。家系は河野氏の一族である橘遠保の流れを汲むという。『若狭小浜杉本院系図』に曰く、楠木正隆の子俊親に貞隆という子がいたという。貞隆は丹波国杉本に生まれ右衛門尉と称し、世に杉本殿と称されたという。家系は

貞隆?貞俊?俊胤?諸正?正胤?委正?信貴?盛長?良海

と続いた。
清和源氏足利氏一門桃井氏流

南北朝時代、足利氏の一門、越中守護として同国を支配した桃井氏の子孫に杉本氏があるとされる。
加賀国の杉本氏

加賀藩士のうちに杉本氏の家系が数流確認される[1]。