本妙寺、本?寺(ほんみょうじ)は日本国内の寺院で、同名の寺院が各地に50か所以上ある。
茨城県土浦市にある日蓮正宗の寺院。山号は亀城山 ? 本妙寺 (土浦市)
かつて下総国葛飾郡(現在の千葉県市川市)に存在した法華宗中山門流の中心寺院。戦国時代に近隣の法花寺と統合されて「法華経寺」を寺号とした ? 「正中山法華経寺」
東京都豊島区にある法華宗陣門流の寺院。山号は徳栄山 ? 本妙寺 (豊島区)
東京都港区白金にある日蓮宗の寺院。山号は金峯山 ? 本妙寺 (東京都港区)
静岡県富士宮市西山にある日蓮宗系単立の寺院。 ? 本妙寺 (富士宮市西山)
静岡県富士宮市北山にある日蓮宗の寺院。 ? 本妙寺 (富士宮市北山)