後南朝（ごなんちょう）とは、明徳3年（1392年）の南北朝合一後、南朝の再建を図った南朝の皇統の子孫や遺臣による南朝復興運動とそれによって樹立された政権、皇室の総称である。

この名称は江戸時代末期に儒学者斎藤拙堂によって付けられたもので、それまで名称は特に決まっていなかった。また後南朝という呼び方も戦後に広まったもので戦前までは定着してはいなかった。
概要後亀山天皇

明徳3年（1392年）の南北朝合一時の約束（明徳の和約）では、天皇は北朝系（持明院統）と南朝系（大覚寺統）から交代で出す（両統迭立）ことになっていたが、応永19年（1412年）に北朝系の後小松上皇の次代として後小松上皇の皇子である称光天皇が即位したことをきっかけに、北朝系によって天皇位が独占されるようになったのに反抗して起こった。

南北朝合一の際に大和国に残った南朝の遺臣として、四条三位資行、日野右小弁邦氏、中園左右衛門佐宗頼、越智通頼、楠木正秀、和田正高、橋本兵庫助、三輪左衛門尉、宇野掃部介の名が残されている[1]。

応永21年（1414年）、4年前に京都を出奔して吉野に潜行していた南朝最後の天皇である後亀山上皇とその皇子小倉宮恒敦を奉じて伊勢国司の北畠満雅が挙兵したが、室町幕府の討伐を受け和解、上皇は2年後に京に帰った。

後亀山上皇の崩御から4年後の正長元年（1428年）、嗣子のなかった称光天皇が崩御したために北朝の嫡流は断絶した。後小松上皇が北朝の傍流（ただし持明院統としては本来の嫡流）である伏見宮家から彦仁王（後花園天皇）を後継者に選ぼうとしたことをきっかけに、北朝は皇統断絶して皇位継承権を失ったと考える南朝側は激しく反発する。北畠満雅は再び小倉宮（後亀山上皇の孫あるいは曾孫で恒敦親王の子[1]。「聖承」という法名で知られるものの、諱は伝えられていない）を奉じて伊勢で挙兵、幕府軍と戦って敗死した。

この事件を皮切りとして、以後、応仁の乱に至るまで、南朝の子孫は反幕勢力や南朝の遺臣らに奉じられて断続的に活動を続けた。

永享元年（1429年）9月には、足利義教が春日詣の途において楠木光正に暗殺されかけるという事件が起こった。

永享9年（1437年）8月には義昭が吉野の天川で還俗し、三井寺にいた説成親王の子・円満院門跡円胤や大和国の郷士・越智維道と共に挙兵したという情報が入り、翌永享10年（1438年）3月には大和国に一色義貫率いる討伐軍が派遣されて、9月には吉野で反抗していた大覚寺の僧侶と山名氏旧臣が討たれた。

また『看聞日記』によれば、同年8月6日には河内国で「楠木兄弟」が挙兵したが、畠山持国に制圧されたという。

『看聞日記』によれば、嘉吉3年（1443年）2月20日には、冨樫氏の紛争に関連して小倉宮蜂起の風説が京に流れた。この小倉宮は小倉宮聖承と考えられる[1]。

嘉吉3年（1443年）9月には源尊秀なる素性不明の人物（『康富記』嘉吉3年9月26日条には「後鳥羽院後胤云々」とあるものの、詳しい素性は不明）に率いられた約300人の武装勢力が御所に乱入、三種の神器のうち剣と神璽を奪い、南朝皇胤の通蔵主・金蔵主兄弟（系譜については諸説取り沙汰されているものの、後亀山上皇の皇弟・護聖院宮惟成親王の孫とする説が有力）を奉じて比叡山に立って籠もった（禁闕の変）。幕府は数日のうちに変を鎮圧、通蔵主は捕えられて四国へ配流（『東寺執行日記』によれば、道中の摂津太田で暗殺されたという）、金蔵主は首謀者の一人とされる日野有光とともに討死した。

この時、持ち去られた剣は心月という僧が清水寺で発見したものの、神璽は後南朝に持ち去られたままであったが、長禄元年（1457年）に至って嘉吉の乱で取り潰された赤松家の再興をめざす赤松家遺臣らが大和・紀伊国境付近の北山（奈良県吉野郡上北山村か）ならびに三之公（同郡川上村）に本拠を置いていた後南朝に虚言を弄して接近[2]、12月2日子の刻（午前0時頃）、大雪が降る中、南朝の末裔という自天王・忠義王兄弟を殺害した上で神璽を奪い返した（長禄の変）。両王子は天明年間に著されたとされる『南朝皇胤紹運録』では父は空因（金蔵主）とされているが、一次史料を重視する立場からはこうした見方に否定的で、長慶天皇流玉川宮の末孫とする説が有力視されている[3]。また、『南帝自天親王玉川上郷御宝物由来』によれば、この時「空因親王」という皇族が近江国甲賀郡に逃れたという。これは、川上村で最も古い村落である高原村落が木地師村落であり、木地師が近江国を発祥としていたからだと考えられる[1]。