国際化学物質識別子
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InChI開発元InChI Trust
初版2005年4月15日 (2005-04-15)[1][2]

最新版1.04 / 2011年9月 (12年前) (2011-09)
リポジトリ

github.com/IUPAC-InChI/InChI

対応OSMicrosoft Windows and Unix-like
プラットフォームIA-32 and x86-64
サイズ4.3 MB
対応言語英語
サポート状況Active
ライセンスIUPAC / InChI Trust Licence
公式サイトhttps://www.inchi-trust.org/
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InChI(International Chemical Identifier)は、標準的かつ人間が読める方法で分子情報を提供し、またウェブ上でのデータベースからの情報の検索機能を提供する。元々、2000年から2005年にIUPACNISTによって開発され、フォーマットとアルゴリズムは非営利であり、開発の継続は、IUPACも参画する非営利団体のInChI Trustにより、2010年までサポートされていた。現在の1.04版は、2011年9月にリリースされた。

1.04版の前までは、ソフトウェアはオープンソースGNU Lesser General Public Licenseで無償で入手できたが[3]、現在は、IUPAC-InChI Trust Licenseと呼ばれる固有のライセンスとなっている[4]
概要

識別子は、情報のレイヤーとして化学物質を記述する。レイヤーには、原子とその結合、互変異性情報、同位体情報、立体化学、電荷の情報がある。しかし全てのレイヤーが提供される訳ではなく、例えば互変異性のレイヤーは省略されることがある。

広く用いられているCAS登録番号とは、以下の点で異なる。

自由に使え、非営利である。

構造情報から計算でき、組織による割当が必要ない。

ほとんどの情報は、人が読むことができる。

そのため、InChIは、IUPAC命名法を一般化、極端な定式化したものと見なすことができる。@media screen{.mw-parser-output .fix-domain{border-bottom:dashed 1px}}単純なSMILES記法よりも多くの情報を表現でき、全ての構造が、データベースの応用に必要な独自のInChI文字列を持つ点が異なっている[要出典]。原子の3次元配列の情報はInChIでは表せず、この目的のためにはPDB等のフォーマットが用いられる。

InChIアルゴリズムは、入力された構造情報を、正規化(冗長な情報の除去)、標準化(各原子に固有の番号を生成)、整列化(特徴の文字列を付与)の3段階の過程で固有の識別子に変換する。

hashed InChIとも呼ばれるInChIKeyは、25文字の固定長であるが、デジタル表現なので人間には読むことができない。InChIKeyの仕様は、ウェブでの検索を可能にするために、2007年9月にリリースされた[5]。InChIそのものとは異なり、InChIKeyは一意ではなく、非常に稀ではあるが重複が発生する[6]

2009年1月、InChIソフトウェアの最終の1.02版がリリースされた。これにより、いわゆるstandard InChIの生成が可能となった。standard InChIは、InChI文字列と、異なったグループによって生成されたキーの比較を容易にし、データベースやウェブ資源等の広範な情報源からのアクセスを可能にした。
フォーマットとレイヤー

InChI formatMIMEタイプchemical/x-inchi
種別chemical file format

全てのInChIは、InChI=という文字列から始まり、バージョン(現在は1)が続く。standard InChIでは、これにSの文字が続く。残りの情報は、レイヤーとサブレイヤーの配列として構造化され、各々のレイヤーは、1つの種類の情報を収める。レイヤーとサブレイヤーは、区切り文字 / で隔てられ、(メインレイヤーの化学式サブレイヤーを除き)固有の接頭文字で始まる。6つのレイヤーと各々の重要なサブレイヤーは、以下の通りである。
メインレイヤー

組成式(接頭文字なし) - 全てのInChIに現れる唯一のサブレイヤー
元素はHill順位則、すなわち炭素C、水素H、他の元素をアルファベット順、で記述される

原子の繋がり(接頭文字: c) - 組成式中の水素以外の元素には出現順に番号が付与される。このサブレイヤーでは、原子が他のどの原子と結合されているかを記述する。

水素原子(接頭文字: h) - 各々の原子にいくつの水素原子が結合しているかを記述する。


電荷レイヤー


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出典: フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)
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