勅願寺(ちょくがんじ)は、時の天皇・上皇の発願により、国家鎮護・皇室繁栄などを祈願して創建された祈願寺のことで、寺格の一つ。
実際には、寺が創建されてから、勅許によって「勅願寺になった」寺も数多い。また勅願寺になれば寺領が得られることもあり、戦国時代頃からは寺の側から働きかけて勅許をもらうという例もあった。
明治時代初期まで勅願寺の指定が行われていたが、神仏分離令によって指定が廃止された。
主要な勅願寺
松島青龍山 瑞巌寺 (臨済宗、宮城県松島町) - 淳和天皇
小比叡山 蓮華峰寺 (真言宗、新潟県佐渡市) - 嵯峨天皇
三守皇山 長光王院 大聖明王寺(真言宗醍醐派、山梨県南巨摩郡)- 高倉天皇
法輪山 正明寺