凝固系（血液凝固因子）とは出血を止めるために生体が血液を凝固させる一連の分子の作用系であり、そうして固まった血栓を溶かして分解するのが線溶系（線維素溶解系）である。多くの病態においてこの二つは密接に関係しているため、本稿では二つをまとめて述べる。 末梢の血管が収縮したり、周囲へ漏れた血液が血管を圧迫することで出血を止める。前者の反応には血小板から放出されるセロトニンやトロンボキサンA2が関わっている。またプロスタグランジンE2が局所の神経を敏感にして痛み信号を中枢神経系に送り、患部への注意を喚起する。中枢神経系は生体外の状況を勘案し、末梢の瑣末な損傷を放置してでもその状況から「闘争か逃走か」をすることが肝要と判断すればノルアドレナリンを分泌してさらに末梢血管を収縮させると同時に、エンドルフィンで痛み信号を遮断して外的状況を「闘争か逃走か」によって打開することを選ぶ。
前駆的な止血の機序
血管因子
血小板因子
傷害を受けた組織の細胞はフォン・ウィルブランド因子を分泌する。
フォン・ウィルブランド因子は血小板表面に結合する。
損傷部位のコラーゲンとトロンビンが血小板を活性化し、ホスホリパーゼCが活性化される。
ホスホリパーゼCはホスファチジルイノシトール二リン酸（PIP2）を分解してイノシトールトリスリン酸（IP3）とする、IP3はセカンドメッセンジャーとして小胞体からCa++の遊離を促す、
血小板は損傷部位に凝集する、またトロンボキサンA2
個々の凝固因子には通常の自然科学の慣例（発見者が名を付ける）ではなく発見順のローマ数字が使われている。これは、次々に新しい因子が発見され、しかも後になってそれは同じ因子の別の形態だと言うことが判明したためである。後者の理由により、いくつかの欠番がある。ただし、最初の4つはローマ数字による呼び方は余り使われない。
フィブリノーゲン・フィブリン（第I因子）
プロトロンビン・トロンビン（第II因子）
組織因子（第III因子、トロンボプラスチン）
カルシウムイオン（第IV因子）
第V因子（プロアクセレリン）：第1染色体長腕（1q23）にマップされたF5遺伝子によってコードされる分子量33000のタンパク質で、肝臓で発現し血流に放出される。第506残基がアルギニンからグルタミンへと変異した多型を（その多型が多いオランダの街の名前から）第V因子ライデン変異(Factor V Leiden)と言い、静脈血栓塞栓症の増加がみられる。黒人・黄色人種ではまれである。また、この遺伝子は常染色体劣性遺伝のため欠損症はまれである。
第VI因子は欠番である（第Va因子の旧名）。
第VII因子（プロコンペルチン）
第VIII因子：X染色体長腕末端（Xq28）にマップされたF8遺伝子 ⇒[1]によりコードされる分子量約3万のタンパク質。血漿中では、フォン・ウィルブランド因子と複合体を形成して存在する。この欠損により血友病Aを罹患する。
第IX因子（クリスマス因子）：X染色体長腕末端近く（第VIII因子に隣接するXq27領域）にマップされたF9遺伝子 ⇒[2]によりコードされる分子量約55000?60000の糖タンパク質。この欠損により血友病Bを罹患する。
上図のように、第VIII因子または第IX因子を介する反応以外はそれをバイパスする反応経路があるが、第VIII因子および第IX因子にはない。それゆえ血友病AおよびBは先天性の凝固障害でも特に重篤な物となる。