二面角
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二面角(にめんかく、: dihedral angle)は、2つの平面(またはその部分集合)がなす角度である。たとえば、二面角が0なら2面は平行(同一の場合を含む)で、π/2(90°)なら垂直である。

二面角は、法線同士の角度として定義される。つまり、2面の法線ベクトルをa、bとすると二面角 φ は ϕ = Arccos ⁡ a ⋅ b 。 a 。 。 b 。 {\displaystyle \phi =\operatorname {Arccos} {\frac {{\boldsymbol {a}}\cdot {\boldsymbol {b}}}{|{\boldsymbol {a}}||{\boldsymbol {b}}|}}}

で表せる。二面角は2π(360°)の周期性を除いて一意には定まらないが、通常は主値として0?π(180°)の範囲で表す。ただし、多面体で内側と外側を区別する場合などでは、0?360°の範囲で表す。また、内側・外側も面の向きも区別しない場合は、 ϕ = Arccos ⁡ 。 a ⋅ b 。 。 a 。 。 b 。 {\displaystyle \phi =\operatorname {Arccos} {\frac {|{\boldsymbol {a}}\cdot {\boldsymbol {b}}|}{|{\boldsymbol {a}}||{\boldsymbol {b}}|}}}

絶対値を取り、0?π/2(90°)の範囲で表す。2つの平面は鋭角鈍角の2つの角度を為すので、そのうち鋭角のほうを取っていることになる。

二面角は、2面に垂直な平面(平行移動自由度を残して決まる)での断面内で考えると、通常の直線同士の角度に還元できる。面の断面は直線なので、断面の2直線がなす角度が2面の二面角である。

二面角は、3つの(でない)ベクトルa、b、cに対しても定義でき、面ab(ベクトルaとbが張る面)と面bcの二面角を考える。また、4つの(異なる)点A・B・C・Dについても、面ABCと面BCDの二面角を考える。面ABCと面BCDの二面角が0でない場合、直線ABと直線CDはねじれの位置にある。このため、ねじれ角(torsion angle)ともいう。
多面体

多面体では、で隣り合う2面の二面角を考える。(単に二面角といった場合は、それ以外の二面角は無視する)凸多面体は、全ての(中心側の)二面角が180°未満の多面体であると定義される。正多面体と準正多面体(半正多面体の特殊例)は、全ての二面角が等しい。このほかに、それらの変形(立方体の変形の直方体など)でもそれは成り立つ。

多面体名面形状面数二面角(面間)
正四面体正三角形470.52
立方体正方形690
正八面体正三角形8109.47
正十二面体正五角形12116.56
正二十面体正三角形20138.18
立方八面体正三角形8125.26(3-4)
正方形6
二十・十二面体正三角形20142.62(3-5)
正五角形12
切頂四面体正三角形4109.47(3-6)
正六角形470.52(6-6)
切頂立方体正三角形8125.26(3-8)
正八角形690(8-8)
切頂八面体正方形6125.26(4-6)
正六角形8109.47(6-6)
切頂十二面体正三角形20142.62(3-10)
正十角形12116.56(10-10)
切頂二十面体正五角形12142.62(5-6)
正六角形20138.18(6-6)
小菱形立方八面体正三角形8144.73(3-4)
正方形18135(4-4)
大菱形立方八面体正方形12144.73(4-6)
正六角形8135(4-8)
正八角形6125.26(6-8)
小菱形二十・十二面体正三角形20159.09(3-4)
正方形30
正五角形12148.28(4-5)
大菱形二十・十二面体正方形30159.09(4-6)
正六角形20148.28(4-10)
正十角形12142.62(6-10)
ねじれ立方体正三角形32153.23(3-3)
正方形6142.98(3-4)
ねじれ十二面体正三角形80164.17(3-3)
正五角形12152.93(3-5)

化学

化学において、二面角とは2原子を共有した2組の3原子を通る面の間の角度である。化学では、原子がA-B-C-Dと結合しているときの二面角が、立体配座を決定する要素のひとつとして重要である。二面角は結合距離結合角に比べ自由度が大きいため、特に比較的大きな有機化合物においては全体構造を決定する重要な要素である。
定義

二面角は2つの交差する面の間の、交線に垂直な3つ目の面上での角度である[1]

ねじれ角(torsion angle[2])は二面角の一例であり、立体化学において化学結合によって連結された分子の2つの部分の幾何的関係を定義するために使われる。
立体化学における二面角「アルカンの立体化学」および「配座異性」も参照


配置の名称syn n-ブタン
ニューマン投影式syn n-ブタン
のこぎり台投影式
二面角の関数としてのブタンの自由エネルギー図。

立体化学において、例えば X…A-B…Y (…は任意の結合次数を持つ結合)のような単結合を持つ分子には、A-B 結合回りの立体配座が異る立体異性体が存在する。この異性体を区別するため、X, A, B の成す平面と A, B, Y の成す平面との間の二面角を用いることができる[3]。0°と±90°の間の角度に対応する立体化学配置はシン(syn、s)と呼ばれ、±90°と±180°の間の角度に対応する配置はアンチ(anti、a)と呼ばれる。同様に、30°と150°あるいは?30°と?150°の間の角度に対応する配置はクリナル(clinal、c、反っているの意)、0°と±30°あるいは±150°と±180°の間はペリプラナー(periplanar、p、平面に近いの意)と呼ばれる。

これら2種類の用語を組み合わせて角度の4つの領域を定義できる。0°から±30°はシンペリプラナー(sp)、30°から90°および?30°から?90°はシンクリナル(sc)、90°から150°および?90°から?150°はアンチクリナル(ac)、±150°から180°はアンチペリプラナー(ap)である。シンペリプラナー配座はシン (syn-) あるいはシス(cis-)配座、アンチペリプラナーはアンチ(anti)あるいはトランス(trans)、シンクリナルはゴーシュ(gauche)あるいはスキュー(skew)とも呼ばれる。

例えば、n-ブタンでは、2つの中心炭素原子と両端のメチル基の炭素原子の一方の観点から2つの面を特定することができる。上に示されている二面角60°のシン配座は二面角180°のアンチ配座よりも不安定である。

高分子では、記号T、C、G+、G?、A+、A?が推奨される(それぞれap、sp、+sc、-sc、+ac、-acに対応する)。
タンパク質の二面角タンパク質の描写。主鎖の二面角が示されている。

1963年にG・N・ラマチャンドラン、C・ラマクリシュナン、V・サシセカランによって開発された[4]ラマチャンドラン・プロットタンパク質構造中のアミノ酸残基の主鎖の二面角 φ に対してエネルギー的に許容される角度 ψ の領域を可視化する方法である。右の図は主鎖の二面角 φ および ψ の定義を表わしている[5]

タンパク質鎖では、図に示されているように3つの二面角 φ(ファイ)、 ψ (プサイ)、 ω (オメガ)が定義される。ペプチド結合の平面性によって、 ω は180°(典型的なトランス配座)あるいは0°(稀なシス配座)に大抵制限される。トランスおよびシス異性体におけるCα原子間の距離はそれぞれ約3.8, 2.9 Aである。シス異性体は主に、Xaa-Proペプチド結合(Xaaは任意のアミノ酸)において観察される。

側鎖の二面角は180°、60°、?60°近くに集まる傾向にあり、それぞれトランス、ゴーシュ+、ゴーシュ?配座と呼ばれる。特定の側鎖の二面角の安定性は隣接した主鎖および側鎖の二面角によって影響される。例えば、原子同士の衝突が増大するためゴーシュ+配座の次にゴーシュ+配座が続くのは稀である。
脚注[脚注の使い方]^ IUPAC, Compendium of Chemical Terminology, 2nd ed. (the "Gold Book") (1997). オンライン版:  (2006-) "dihedral angle".
^ IUPAC, Compendium of Chemical Terminology, 2nd ed. (the "Gold Book") (1997). オンライン版:  (2006-) "torsion angle".


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