マーカー（Marker）とは、一般には、目印・標識として利用できるもの、あるいは目印・標識をつけるものをいう。

筆記具のマーカー：しるしをつけるための筆記具。一般的にはフェルトペン（マーキングペン、マーカーペン、サインペンなど複数の呼び名がある）のことを指すが、固形塗料を擦り付けてしるしを付けるマーカー (筆記具)もある。

携帯マーカー：携帯タイプの自発的発光器。携帯電話のストラップに使う。

医学におけるマーカー：疾病や生理的状態を示す物質のこと。バイオマーカー (薬学)を参照。その他体内に腫瘍があることを示す腫瘍マーカーなど。

遺伝子マーカー：生物の遺伝的な性質を示す特徴的な遺伝子またはDNA配列。

マーカー遺伝子：遺伝子工学で人工的に目印として用いる遺伝子。

マーカー (言語学)：文法機能を示す単語や接辞など。

マーカーランプ：主に貨物自動車の荷台側面下部に付けられる灯火器具。「側方灯」とも呼ばれる。

マーカー (ゴルフ)：ゴルフのスコア記録者。ストロークプレーで競技者のスコアを記録するように委員会が選任した者｡通常、同伴競技者がマーカーを務める｡

爆発物マーカー

キャットアイマーカー

マーカービーコン - 計器着陸装置の構成要素
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