フルートで演奏される曲目は、フルートのために書かれた曲、もしくはフルート奏者によって吹かれる代表的な曲を列挙し、また必要ならば解説を付け加えたものである。
協奏曲についてはフルート協奏曲を、フルートオーケストラ作品についてはフルートオーケストラを参照。
他の楽器との多重協奏曲
ヴォルフガング・アマデウス・モーツァルト：フルートとハープのための協奏曲 ハ長調 K.299 （297c）
オリヴィエ・メシアン：四重協奏曲（フルート、ヴァイオリン、チェロ、ピアノと管弦楽のための）（未完、妻イヴォンヌ・ロリオ補作）
武満徹：海へII（アルト・フルート、ハープと弦楽合奏のための）
ミカエル・ジャレル：フルート、オーボエ、クラリネットと管弦楽のための協奏曲
管弦楽曲の中で特徴的なソロを含む楽曲
ヨハン・ゼバスティアン・バッハ： マタイ受難曲
ヨハン・ゼバスティアン・バッハ：ミサ曲 ロ短調
ヨハン・ゼバスティアン・バッハ：管弦楽組曲 第2番 ロ短調
クリストフ・ヴィリバルト・グルック：オペラ『オルフェオとエウリディーチェ』 - 「精霊の踊り」
ヨハネス・ブラームス：交響曲第4番 - 第4楽章
ジョルジュ・ビゼー：『カルメン』 - 第3幕への間奏曲
ジョルジュ・ビゼー：『アルルの女』第2組曲 - 「メヌエット」
ピョートル・チャイコフスキー：パレエ音楽『くるみ割り人形』 - 「葦笛の踊り」[1]
エドヴァルド・グリーグ：『ペール・ギュント』第1組曲 - 「朝」
ガブリエル・フォーレ：組曲『ペレアスとメリザンド』 - 「シシリエンヌ」
ガブリエル・フォーレ：パヴァーヌ
クロード・ドビュッシー：牧神の午後への前奏曲（フルートとピアノ二重奏への編曲もある）
モーリス・ラヴェル：マ・メール・ロワ
モーリス・ラヴェル：『ダフニスとクロエ』第2組曲 - 「無言劇」
モーリス・ラヴェル：ボレロ
イーゴリ・ストラヴィンスキー：『ペトルーシュカ』第1部 - 「導入」
イーゴリ・ストラヴィンスキー：『春の祭典』
ルロイ・アンダーソン：ペニー・ホイッスル・ソング
複数のフルートによる室内楽曲
湯浅譲二：相即相入（2本のフルートのための）
平義久：サンクロニー（2本のフルートのための）、風紋（4本のフルートのための）、琥珀（2本のフルートのための）（2005年、遺作）
ソフィア・グバイドゥーリナ：フルート四重奏曲
フィリップ・ユーレル
大編成のものはフルートオーケストラを参照。
ゲオルク・フィリップ・テレマン：パリ四重奏曲集
ヴォルフガング・アマデウス・モーツァルト：フルート四重奏曲（第1番 ニ長調、第2番 ト長調、第3番 ハ長調、第4番 イ長調）