SARSコロナウイルス2-オミクロン株（サーズコロナウイルスツー オミクロンかぶ、英語: SARS-CoV-2 Omicron variant、別名: 系統 B.1.1.529）は、新型コロナウイルス感染症 (COVID-19) の原因ウイルスとして知られるSARSコロナウイルス2 (SARS-CoV-2) の変異株である[1]。既知の最初の症例は、2021年11月24日に南アフリカ共和国から世界保健機関（WHO）に初めて報告された[2]。

同年11月26日、WHOは懸念される変異株（VOC）に指定し、ギリシアアルファベットの15番目の文字オミクロン（ο:Omicron）を基にオミクロン株（Omicron variant）と命名した[3][4][5][6]。

オミクロン株は多数の変異を持ち、いくつかの変異は新規のものであり[7]、いくつかの変異はオミクロン株の発見時にほとんどのワクチンが標的に使用していたスパイクタンパク質に影響を与えるものである。この変異のレベルにより、伝染性、免疫回避、ワクチン耐性に関する懸念が浮上した。その結果、オミクロン株は短期間のうちに懸念される変異株に指定され、一部の国では感染拡大を遅らせるために南アフリカ共和国などアフリカの一部の国を対象とした渡航禁止令が導入された。

オミクロン株は同年末から2022年にかけて、それまで主流の株であったデルタ株を置き換えて世界の主流株となっている。また、BA.2やBA.4、BA.5など亜系統も出現しており、既存の系統から置き換わりつつ流行を度々引き起こしている（#亜系統も参照）。
特徴
命名

2021年11月26日、WHOのSARS-CoV-2の進化に関するTechnical Advisory Groupは、PANGO識別子（英語版）B.1.1.529を懸念される変異株と宣言し、ギリシア文字のオミクロン（ο:Omicron）として指定した[5][8][9]。前のミュー株（μ:Mu）の次のギリシア文字であるニュー（ν:Nu）とクサイ/クシー（ξ:Xi）は飛ばされることになったが、理由はニューが英語の「New」と[5][6]、クサイ/クシーの英語表記のXiが一般的な中国の姓(→en:Xi (surname))と混同しやすいためである[6][10][11]。特にクサイ/クシーを飛ばすことについては、中国共産党総書記兼国家主席の習近平（Xi Jinping）の姓との重複を回避した可能性も指摘されたが[5][12]、WHOは「クサイ（xi）は、よくある姓なので使用しなかった」、「我々は特定の文化、社会、国家、地域、民族、職業群に対する攻撃を防ぐ疾病の命名法に従っている」と説明している[13][注 1]。

一部の英語話者の間では、ギリシア語のアルファベットに精通していないためか、変異株の名前が「オムニクロン（Omnicron）」と誤って発音されることがある[15][16][17][18]。

GISAIDプロジェクトは識別子GR/484Aを割り当て、Nextstrain（英語版）プロジェクトはclade識別子21Kを割り当てた[3]。
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オミクロン株のゲノム配列

オミクロン株には多数の変異が存在し、科学者はいくつかの変異を懸念している[19]。32の変異は、感染によって生成された抗体や広く投与されている多くのワクチンの主な抗原の標的となっている、スパイクタンパク質に影響がある。これらの変異の多くは、他の株では観察されていないものである[20][21]。