このページ名「ウァリドナウィリア」は暫定的なものです。
代案としてはバリドナウイルス域があります。(2022年6月)
域:バリドナウイルス域 Varidnaviria
ウァリドナウィリア(Varidnaviria)またはバリドナウイルス域[1]は、2019年に国際ウイルス分類委員会(ICTV)によって提案されたウイルスの分類群(域、Realm)。垂直のゼリーロール構造を持ち、疑似六量体カプソマーを形成する主要カプシドタンパク質(MCP)を持つ二本鎖のDNAウイルスを含む[2][3]。また、これらの構造を持たない場合であっても、進化的に強く関連付けられるウイルスがここに含まれる[2]。多くの場合、パッケージタンパク質やDNAポリメラーゼも進化的に共通している。
垂直のゼリーロール構造とは、対向する4対の逆平行βシート(ゼリーロール)が、カプシド殻面に対して垂直に配置していることを意味する。リボウィリア(リボウイルス域)の一部ウイルスも主要カプシドタンパク質にゼリーロール構造を持つが、これらは大半がRNAウイルスであり[4]、またゼリーロールがカプシド殻面に対して平行に配置している。
ボルティモア分類でいう第1群(2本鎖DNAウイルス)の一部がウァリドナウィリアに対応している。残りの2本鎖DNAウイルスの大半は、ドゥプロドナウィリア(デュプロドナウイルス域)に属している。ドゥプロドナウィリアは尾部を持つ物が多いことから、ウァリドナウィリアは無尾の二本鎖DNAウイルスと呼ばれることがある。 ウァレドナウィリアの起源は非常に古いと推定されているが、出現時期は不明である。細菌や古細菌に感染するスファエロリポウイルス科の垂直なシングルゼリロール構造を持つ主要カプシドタンパク質(MCP)は、コアヒストンに結合する分子シャペロン、ヌクレオプラスミン
進化
巨大核質DNAウイルスやアデノウイルス科を含む、真核生物に感染する一群のウイルスは、ポリントンと呼ばれる大型のトランスポゾンと関係がある[6][7]。ミトコンドリア獲得イベントを通じて、原核生物から持ち込まれたテクチウイルスに近縁なウイルスがポリントンとして真核生物に定着し、そこから巨大核質DNAウイルスやアデノウイルス科、ヴィロファージなどの、真核生物に感染する二本鎖DNAウイルスの大半が進化出現したシナリオが提唱されている[8]。ポリントンと巨大核質DNAウイルスは、ダブルゼリーロール構造を持つ主要カプシドタンパク質のほか、システインプロテアーゼ、ペントン、A32様ATPアーゼ、一部のヘリカーゼやインテグラーゼなどの構成要素を共有する[7]。 2019年に国際ウイルス分類委員会(ICTV)によって提案された分類は以下のとおりである[2][9]。
分類
バンフォルドウイルス界 Bamfordvirae(垂直のダブルゼリーロール主要カプシドタンパク質)
ヌクレオサイトウイルス門 Nucleocytoviricota
メガウイルス綱 Megaviricetes
ポッケスウイルス綱
プレプラスミウイルス門 Preplasmiviricota
マウェリウイルス綱 Maveriviricetes(ヴィロファージ)
テクティリウイルス綱 Tectiliviricetes(アデノウイルス科、細菌や古細菌に感染するウイルスを含む)
ヘルウェティアウイルス界 Helvetiavirae(垂直のシングルゼリーロール主要カプシドタンパク質)
ディウィドウイルス門 Dividoviricota
ラセルウイルス綱 Laserviricetes(好塩古細菌や好熱細菌に感染するスファエロリポウイルス科のみを含む)
脚注[脚注の使い方]^ 「国際ウイルス分類委員会の新しい分類体系(「ICTV New Taxonomy Release(2019)」)で提唱された目より上位の分類(2020年3月承認)」神谷茂 監修、錫谷達夫・松本哲哉 編『標準微生物学 第14版』付録、医学書院、2021年、表27-4、2022年6月12日閲覧。
^ a b c Koonin EV "et al." (2019). “Create a megataxonomic framework, filling all principal taxonomic ranks, for DNA viruses encoding vertical jelly roll-type major capsid proteins”. ICTV. doi:10.13140/RG.2.2.14886.47684.
^ 例外的に一本鎖DNAのFinnlakevirusを除く
^ RNAウイルス以外では、(モノドナウィリア(モノドナウイルス域)の二本鎖DNAウイルスである)パピローマウイルス科及びポリオーマウイルス科が水平のゼリーロール構造を主要カプシドタンパク質(MCP)を持つが、これらはRNAウイルスからMCP遺伝子を取得したと考えられている
^ a b c “Multiple origins of viral capsid proteins from cellular ancestors”. Proc Natl Acad Sci U S A 114 (12): E2401-E2410. (21 March 2017). doi:10.1073/pnas.1621061114. PMC 5373398. .mw-parser-output cite.citation{font-style:inherit;word-wrap:break-word}.mw-parser-output .citation q{quotes:"\"""\"""'""'"}.mw-parser-output .citation.cs-ja1 q,.mw-parser-output .citation.cs-ja2 q{quotes:"「""」""『""』"}.mw-parser-output .citation:target{background-color:rgba(0,127,255,0.133)}.mw-parser-output .id-lock-free a,.mw-parser-output .citation .cs1-lock-free a{background:url("//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/6/65/Lock-green.svg")right 0.1em center/9px no-repeat}.mw-parser-output .id-lock-limited a,.mw-parser-output .id-lock-registration a,.mw-parser-output .citation .cs1-lock-limited a,.mw-parser-output .citation .cs1-lock-registration a{background:url("//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/d/d6/Lock-gray-alt-2.svg")right 0.1em center/9px no-repeat}.mw-parser-output .id-lock-subscription a,.mw-parser-output .citation .cs1-lock-subscription a{background:url("//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/a/aa/Lock-red-alt-2.svg")right 0.1em center/9px no-repeat}.mw-parser-output .cs1-ws-icon a{background:url("//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/4/4c/Wikisource-logo.svg")right 0.1em center/12px no-repeat}.mw-parser-output .cs1-code{color:inherit;background:inherit;border:none;padding:inherit}.mw-parser-output .cs1-hidden-error{display:none;color:#d33}.mw-parser-output .cs1-visible-error{color:#d33}.mw-parser-output .cs1-maint{display:none;color:#3a3;margin-left:0.3em}.mw-parser-output .cs1-format{font-size:95%}.mw-parser-output .cs1-kern-left{padding-left:0.2em}.mw-parser-output .cs1-kern-right{padding-right:0.2em}.mw-parser-output .citation .mw-selflink{font-weight:inherit}PMID 28265094. https://www.pnas.org/content/114/12/E2401 2020年6月10日閲覧。