特別番組
詳細はJNN報道特別番組を参照
選挙・台風・地震や、他に、大きな事件・事故の際に特別番組を編成、放送する。
開票状況を伝える特別番組を放送。出口調査などを駆使して早く、分かりやすく伝える。
選挙開票特別番組 票決!ライブ
乱!総選挙2005
規模に応じて「速報のみの対応」「速報＋臨時ニュース」「速報＋臨時ニュースの後、特番へ移行」と、大まかに分けて3つのパターンが存在する。
津波情報に関しては、警報が発令された場合、CM中でも常時文字情報を出し続けることになっている（ただし「ニュース速報」と違い、系列各局のローカル処理となるため、地域によってその都度対応が異なる）。
台風時は、各局で編成されるため、すべての加盟局に向けた特別番組の放送は滅多にしない。また、通常のニュース・情報番組のなかで、番組の多くを台風情報に充てている。
ブロック制作番組
東北・新潟地区
アナナビ（系列外の秋田テレビ<FNS>にもネット。2004年3月終了）
ふしぎのトビラ（系列外秋田放送＜NNS＞にもネット。提供は東北電力。月一回の放送）
中部地区（もともと甲信越静岡の4局だったが、後に北陸の2局も参加。東海は含まず）
ニッポンど真ん中!
近畿・中国・四国・大分地区
西日本8局特番（かつては地域情報系統として放送されていたが現在はMBS主体で報道ドキュメンタリー系統になっている）
山口・九州・沖縄地区(e-JNN)
味わいぶらり旅（九州6局のみ）
JNN九州・沖縄ドキュメント ムーブ
窓をあけて九州（九州6局のみ）
冒険王国思いっきりトムソーヤ（2001年9月終了、九州6局のみ）
電撃黒潮隊（アートネイチャー1社提供、2002年9月終了）
九州遺産（TYS除く、2002年9月終了）BS-iでは現在も放送
フィッシュEYE→フィッシングナビ（終了、TYS除く）
この他にも年1?2回、JNN共同制作番組をJNN各局で放送する。
ローカルワイドニュース（夕方）については一覧を参照。
補足
「○○放送」という名前のJNN加盟局は全てアナログ親局がVHFでラテ兼営局であり、ほとんどがその地域において最初の民放テレビ局となっていて、概ね北海道、東北の太平洋側、北陸、中国地方の一部、信越静、中京、九州地方の全局で、JRNにも同時加盟している（ラジオ部門を子会社化したTBSも含む、JNNを脱退した局を除く）なおこれらの放送局はほとんどの局でキユーピー3分クッキングのCBC版を放送している。
JNN系列局（BS-i含む）は、すべてEPGのGガイドホスト局となっている。
系列局がスクープしたニュースでも、「JNNの取材により明らかになった-」とコメントする。これはネット級のニュースになった時点でJNN基金より取材費が補助されるためである。
気象関連の画像については加盟各局が使用する画像をTBSで一括して作成・配信している。この仕組みはNHKを含めたネットワークの中でJNNのみが採用している仕組みであり、加盟全局の予報イメージ（画面、予報マークなど）がこれによりほぼ統一されている[5]。
また、予報マークのうち「雨」は一般的な「傘」ではなく「雲から雨粒が落ちる」イメージに、「雪」はHBCのみ「雪だるま」で、その他の局は「雪の結晶」をイメージしたものが使われている[6]。
テロップ送出時のチャイム音は、他系列と違いJNN系列全28局統一で「ポッポ、ポッポ」[7]。
また,テロップ表示時の放送局名表示はニュース速報の場合、基本的に｢JNNニュース速報｣と表示される。ただし、これはあくまで大きなニュース（主にTBSからデータ配信される速報）の場合であり、加盟各局のエリア内で発生したニュース及び気象・交通関連情報や一部の地震情報については、加盟各局それぞれの名前で速報が出される。
かつて（1980年代、一部は90年代初頭まで）、JNNのニュース番組冒頭では「ネットワーク共同制作」との考え方と、報道番組にはつかない「製作著作クレジットの代わり」という側面から、加盟各局がそれぞれの社名ロゴを画面右下に数秒間表示していた[8]。
2008年からTBS、MBS以外の系列局で、エコキャンペーン「結構です!レジ袋」を展開している。（三大都市圏では唯一CBCが参加し、キャンペーンのブログもCBCが幹事になっている）