西鉄バスジャック事件以降、誘発されるように犯行予告を書き込んで逮捕される人間や、それを実行に移し逮捕される人間が現われる。また、爆破・殺人の予告書き込みによる逮捕者を輩出しているため、大きな事件があると、各板で頻繁に書き込まれている殺害・襲撃予告と事件の関連性を関係機関がチェックしているとされる他、警察庁のサイバーフォースが定期的に検索を掛けている。また明らかにいたずら目的と思われる些細な犯罪予告の書き込みでも、他のユーザーが運営側などに通報して(「通報しますた」)逮捕などに至ることがあり、多くのユーザーの間では犯罪予告は禁句となっている。
さらに、デマや悪意のある書き込みで企業が不利益を被らないよう、それらの監視を専門とする部署を設けたり監視を外部に委託する企業が、大企業を中心に増えているとも言われており、実際に大手広告代理店の電通がガーラと組んで、掲示板における自社に関する書き込みを監視、通報するシステムを顧客企業に有償で提供している。これらの2ちゃんねるを使ったサービスの提供により利益を得ることはユーザーや運営側も当初から問題視されており、トップページ（ ⇒[3]）の下部にもそれに対する注意を喚起する記載がある。
一部の「板」や「スレッド」において、中華人民共和国（中国）、大韓民国（韓国）、朝鮮民主主義人民共和国（北朝鮮）などの国に対し、差別的な用語を用いての罵倒があまりにもはげしいとの指摘がある。これらは特に、それらの国が歴史認識や領土問題などをめぐって日本の右派・保守派の主張に反する発言や行動を行った際に非常に顕著である。また、ウィキペディアに対しても、その内容に（彼らの主張するところの）「反日」的なものが多々あると主張し、またそれは朝鮮人や中国人によるものであるとしてその内容の書き換えを行うためのスレッド[10]やまとめウィキ[11]が存在している。
その他、同和利権などを理由にした同和、創価学会公明党への批判、学歴による差別（特にブランド大学至上主義、「高卒や中卒＝まともな人間でない」というレッテル張り）、精神障害者や知的障害者に対する差別（『キチガイ』や『池沼』などの差別用語の連発）を含む書き込みがなされることがある。荒らしや気に入らない意見を書き込む人を障害者呼ばわりする者もいる。地理お国自慢板]]で見られるような地域対立感情（特に関西地方などへの罵倒、東京至上主義）も各板で噴出しており、ことあるごとによその地方住民たちを侮辱している。また、一般ユーザが作成するレスやスレッドばかりでなく管理人が直接作成する板の中にも「地下アイドル（AKB48）」というような差別表現を含み、特定個人･団体を誹謗中傷する名称の板が存在する。
これに対し、差別や偏見を臭わせる書き込みは2ちゃんねる以外のYahoo!掲示板などにも見られるほか、掲示板以外の場でも差別、偏見は存在する。差別、偏見は社会現象として表れるものであり、差別、偏見の書き込みが2ちゃんねるで見られるのは社会現象の反映でしかなく、2ちゃんねるだけを差別、偏見の場と主張するのはおかしいのではないかとの主張がある。また、2ちゃんねるの利用者は990万人とまで言われ、様々な思想をもった人間が存在することから、その中から一部の極端な例だけを取り上げて差別、偏見、罵倒の温床と批判すること自体が、2ちゃんねるを差別と偏見の目で見ているのではないかと主張する意見もある。
2ちゃんねるは、18歳未満閲覧が望ましくないとされている「エロ」・「グロ」・「バイオレンス」サイトではないが、全ての掲示板で「アダルトサイト」かと見まがうような、「出会い系サイト」などの広告を多数掲載している。これらは18歳未満の少年・児童が2ちゃんねるを閲覧する際や、あるいは検索サイトの検索結果にもひっかかってしまい、必然的に目に入ってしまうため、彼らに過剰なエロ分野への興味を抱かせる恐れがあることや、情報の真偽や価値を見抜く力をまだ十分に持たない場合（これは少年・児童だけに限らないが）には大きな悪影響を受けてしまう危険性があること、出会い系サイトを媒介して事件性を持つ少年被害が散見される現状をかんがみると、何らかの規制が必要ではないかとの意見がある。その一方で監督する立場である保護者などがアクセス遮断などの対応をとることはほとんどない。ゆえに実際には児童らは自由に2ちゃんねるを閲覧できる環境がほとんどであるといえる。西鉄バスジャック事件の犯人が「ネオむぎ茶」のハンドルを駆使して多数の投稿を行っていたことや、中学生時代から2ちゃんねるに入れ込み諏訪連続放火事件を起こした「くまぇり」と自称する容疑者など、折に触れて2ちゃんねると少年の人格形成との関連性が取り沙汰されている。
2007年2月にWebフィルタリング業者が行った調査によると、「小・中学生の2ちゃんねる利用率は12.2%」という結果が出ており、すでに小・中学生の1割以上が「2ちゃんねらー」であるとする統計がある。上記のアダルト広告による悪影響への危惧はもちろん、一部の「板」において見られるような殺伐とした雰囲気を身に付ける危険が強いほか、他者への誹謗中傷をいとわなくなったり、ネットいじめや荒らし行為を通じて排他的・破壊的行動を行うことに快感を覚えるようになる危険性があるなど、成長期にある彼らの人格・精神の形成上、非常に好ましくないとする意見もある。
一方、「こういった環境に慣れることにより上記の行動、言動などに耐性をつけることにより精神的に成長し、また、何が嘘か真実かなどといったを判断をすることにより、判断力、メディア・リテラシーを教育できる」とする意見もある。ネットワーク社会への影響でも述べられているように、特に「嘘を嘘と見抜く」メディア・リテラシー能力は情報化社会で生き抜くには必須の能力であるのは確かであり、（方法の是非はともかく）その習得自体は好ましいものである。しかし、その過程で嘘の情報を信じ込んでしまったり、意見や考え方が偏ってしまったり、人間不信になってしまったり、ネット中毒になってしまう可能性もあるため、リスクがあることを理解し、自分や周囲の人間も含めて利用には細心の注意が払われるべきであろう。
以降では、社会の反応について、功罪両方の面を交えて記述する。
2ちゃんねるはありとあらゆる情報に関する板があり、交換される情報は多種多様である。消費者や技術者などが商品・サービス・技術などに関する情報を交換するCGMサイトとして利用されている板や、学問上の議論に利用される学問板もある。