内部部局
林政部
林政課、企画課、経営課、木材産業課、木材利用課の5課からなる。林政課は庁内取りまとめ、企画課は白書や税制・金融などを担当、経営課は森林組合や労働対策、きのこなどの特用林産物を担当、木材産業課は木材の生産・加工、木材利用課は木材利用の推進、貿易を担当する。
森林整備部（部長 針原寿朗）
計画課、整備課、治山課、研究・保全課の4課からなる。計画課は森林計画や公共事業の取りまとめなど全般を担当する中心的な課、整備課は造林や林道、緑資源機構などを所管し、治山課は治山事業を担当する。研究・保全課は研究普及や森林保全などを担当する。
国有林野部
国有林野に関することを所管し、管理課、経営企画課、業務課、職員・厚生課の4課からなる。国有林野事業は外材の流入などによる国産材の価格低迷等で赤字が拡大し、03年度末現在その額は1兆2800億円にも上る。
森林・林業基本法第29条により設置され、農林水産大臣又は関係大臣の諮問に応じて森林・林業に関する調査審議を行う。委員（30人以内で組織）は学識経験のある者のうちから、農林水産大臣が任命する。
地方支分部局
森林管理局（7）
北海道森林管理局
東北森林管理局
関東森林管理局
中部森林管理局
近畿中国森林管理局
四国森林管理局
九州森林管理局
森林管理署（98）
支署（14）
歴代の林野庁長官
氏名の末尾に「事」との表示があるのは事務官出身者を示し、無表示は技官出身者を示す。
また、※印を付してあるのは林野庁長官のあと、その直後か次に別の官職に在任した後に、農林水産事務次官を務めたことを指す。
林野庁長官
代氏 名在任期間退任後の主要な役職
1三浦辰雄 1949年−1950年参議院議員
2横川信夫 1950年−1952年参議院議員、法務政務次官、栃木県知事
3柴田榮 1952年−1955年参議院逓信・内閣・大蔵各委員長、労働政務次官
4石谷憲男 1955年−1958年参議院地方行政委員長
5山崎齊 1958年−1961年参議院農林水産委員長
6吉村清英 1961年−1963年森林開発公団理事長
7田中重五 1963年−1966年
8若林正武 1966年−1967年参議院地方行政委員長、北海道開発政務次官
9片山正英 1967年−1970年参議院文教委員長、科学技術政務次官、農林政務次官
10松本守雄 1970年−1972年
11福田省一 1972年−1974年森林開発公団理事長
12松形祐堯 1974年−1976年林業信用基金理事長、宮崎県知事
13藍原義邦 1976年−1979年林業信用基金理事長
14須藤徹男 1979年−1981年
15秋山智英 1981年−1984年森林開発公団理事長
16角道謙一事※1984年農林漁業信用基金理事長、農林中央金庫理事長
17田中恒寿 1984年−1986年林業信用基金理事長
18田中宏尚事※1986年−1988年農業者年金基金理事長、農林漁業信用基金理事長
19松田堯 1988年−1989年森林開発公団理事長
20甕滋事※1989年−1990年農林漁業信用基金理事長、地方競馬全国協会会長
21小澤晋照 1990年−1992年林政総合調査研究所理事長
22馬場久萬男事1992年−1993年水資源開発公団副総裁、農林漁業信用基金理事長
23塚本隆久 1993年−1995年森林開発公団理事長
24入澤肇事1995年−1997年参議院議員
25高橋勲 1997年−1998年農林漁業信用基金副理事長、林野弘済会会長
26山本徹事1998年−1999年農畜産業振興機構理事長
27伴次雄 1999年−2001年緑資源機構理事長
28中須勇雄事2001年大日本水産会会長
29加藤鐵夫 2001年−2003年農林漁業信用基金副理事長
30石原葵事※2003年−2004年全国米麦改良協会会長
31前田直登 2004年−2006年緑資源機構理事長
32川村秀三郎事2006年
33辻健治 2007年−
主な職務
民有林行政
国有林野事業
国有林の管理経営（森林管理局職員の中で特に指定を受けた者は「国有林野・部分林・公有林野官行造林、その林野の産物に関する罪又はその林野・国営猟区における狩猟に関する罪」について特別司法警察職員としての権限を有する。）
なお国有林野事業は三公社五現業中で最後まで国営で残っている事業であり、独立行政法人化等が検討されていると報じられている。
外部リンク
⇒林野庁ホームページ
⇒国有林野事業ホームページ
表・話・編・歴農林水産省
幹部農林水産大臣 - 農林水産副大臣 - 農林水産大臣政務官 - 農林水産事務次官 - 農林水産審議官 - 農林水産大臣秘書官
内部部局大臣官房(国際部、統計部、協同組合検査部) - 総合食料局(食糧部) - 消費・安全局 - 生産局(畜産部) - 経営局 - 農村振興局(企画部、整備部)