戦時体制の中で、医者の確保のために設置され、各大学の医学部と臨時附属医学専門部（のちに附属医学専門部と改称）とは並立していた。附属医学専門部は戦後に廃止され、医学部のみが存続した。
帝国大学

北海道帝国大学臨時附属医学専門部（北海道大学医学部に吸収され廃止）

東北帝国大学臨時附属医学専門部（東北大学医学部に吸収され廃止）

東京帝国大学臨時附属医学専門部（東京大学医学部に吸収され廃止）

名古屋帝国大学臨時附属医学専門部（名古屋大学医学部に吸収され廃止）

京都帝国大学臨時附属医学専門部（京都大学医学部に吸収され廃止）

大阪帝国大学臨時附属医学専門部（大阪大学医学部に吸収され廃止）

九州帝国大学臨時附属医学専門部（九州大学医学部に吸収され廃止）

旧六医科大学

千葉医科大学臨時附属医学専門部（千葉大学医学部に吸収され廃止）

新潟医科大学臨時附属医学専門部（新潟大学医学部に吸収され廃止）

金沢医科大学臨時附属医学専門部（金沢大学医学部に吸収され廃止）

岡山医科大学臨時附属医学専門部（岡山大学医学部に吸収され廃止）

熊本医科大学臨時附属医学専門部（熊本大学医学部に吸収され廃止）

長崎医科大学臨時附属医学専門部→長崎高等学校（長崎大学医学部に吸収され廃止）

官立

官立・公立の医専の多くは、戦時体制の中で、医者の確保のために設置された。期間は五年、前期二年が大学予科に相当、後期三年が医学部に相当した。なお戦後、設備等の事情で廃校になったものがある（これに関しては戦後特設高校も参照）。
青森医学専門学校→弘前医科大学に併設（弘前大学医学部に吸収され）

前橋医学専門学校→前橋医科大学に併設（群馬大学医学部に吸収され）

東京医学歯学専門学校医学科→東京医科歯科大学に併設（東京医科歯科大学医学部に吸収され）

松本医学専門学校→松本医科大学に併設（信州大学医学部に吸収され）

徳島県立徳島医学専門学校→徳島医学専門学校（官立に移管）→徳島医科大学に併設→徳島高等学校（徳島大学医学部に吸収され）

米子医学専門学校→米子医科大学に併設（鳥取大学医学部に吸収され）

樺太医学専門学校

公立
戦前

愛知県立医学専門学校→愛知医科大学に吸収され廃止→名古屋医科大学→名古屋帝国大学医学部

京都府立医学専門学校（京都府立医科大学）

大阪府立大阪医学校（専門学校令準拠の大阪府立大阪医科大学→大学令準拠の大阪医科大学→大阪帝国大学医学部）

新潟県立新潟医学校→新潟医学専門学校→新潟医科大学に吸収され廃止

（私立→県立）熊本医学専門学校（熊本医科大学に吸収され廃止→熊本大学医学部）

戦時

官立・公立の医専の多くは、戦時体制の中で、医者の確保のために設置された。期間は五年、前期二年が大学予科に相当、後期三年が医学部に相当した。なお戦後、設備等の事情で廃校になったものがある（これに関しては戦後特設高校も参照）。
山梨県立医学専門学校（山梨県立高等学校→廃止）

横浜市立医学専門学校（横浜医科大学→横浜市立大学医学部）

三重県立医学専門学校（三重県立医科大学→三重県立大学医学部→三重大学医学部）

奈良県立医学専門学校（奈良県立医科大学）

和歌山県立医学専門学校（和歌山県立医科大学）

大阪市立医学専門学校（大阪市立医科大学→大阪市立大学医学部）

広島県立医学専門学校（広島県立医科大学→広島医科大学→広島大学医学部）

兵庫県立医学専門学校（兵庫県立医科大学→兵庫県立神戸医科大学→神戸大学医学部）

山口県立医学専門学校（山口県立医科大学→山口大学医学部）

福岡県立医学歯学専門学校医学科（県立福岡高等学校→廃止）

鹿児島県立医学専門学校（県立鹿児島医科大学→県立鹿児島大学医学部→鹿児島県立大学医学部→鹿児島大学医学部）

外地
台湾総督府医学校→台湾総督府医学専門学校→台北医学専門学校→台北帝国大学附属医学専門部→台湾大学医学専修科（台湾大学医学院に吸収され）

京城医学専門学校（ソウル大学校医科大学）

大邱医学専門学校（慶北大学校医科大学）

光州医学専門学校（全南大学校医科大学）

平壌医学専門学校

咸興医学専門学校

旅順医学専門学校（廃止）

セブランス連合医科専門学校→旭医学専門学校→セブランス医科大学→延世大学校医科大学

私立
東京慈恵会医院専門学校（東京慈恵会医科大学）