詳細は旧制薬学専門学校を参照
旧制高等学校医学部系
第一高等学校医学部薬学科→1901年千葉医学専門学校薬学科→→千葉医科大学附属薬学専門部（千葉大学薬学部）
第二高等学校医学部薬学科→医学科に吸収され一旦廃止→→東北大学医学部薬学科（東北大学薬学部）
第三高等学校医学部薬学科→医学科に吸収され一旦廃止→→岡山大学医学部薬学科（岡山大学薬学部）
第四高等学校医学部薬学科→1901年金沢医学専門学校薬学科→→金沢医科大学附属薬学専門部（金沢大学薬学部）
第五高等学校医学部薬学科→1918年長崎医学専門学校薬学科→→長崎医科大学附属薬学専門部（長崎大学薬学部）
薬学専門部
1949年 大阪大学附属薬学専門部（大阪薬学専門学校より）→（大阪大学医学部薬学科に吸収され→大阪大学薬学部）
官立
1920年（官立）富山薬学専門学校（富山県立薬学専門学校より）→（富山大学薬学部→富山医科薬科大学薬学部→富山大学薬学部）
1925年（官立）熊本薬学専門学校（九州薬学専門学校より）→（熊本大学薬学部）
公立
1932年 （市立）岐阜薬学専門学校→（岐阜薬科大学）
1946年 名古屋市立名古屋薬学専門学校（名古屋薬学専門学校より）→（名古屋薬科大学→名古屋市立大学薬学部）
1952年 静岡県立薬学専門学校（静岡薬学専門学校より）→（静岡薬科大学→静岡県立大学薬学部）
私立
1917年 東京薬学専門学校→→（東京薬科大学）
1919年 京都薬学専門学校→（京都薬科大学）
1923年 明治薬学専門学校→→（明治薬科大学）
1925年 道修女子薬学専門学校→（大阪薬科大学）
1930年 帝国女子医学薬学専門学校→（東邦大学）
1930年 東京女子薬学専門学校→→（明治薬科大学）
1930年 昭和女子薬学専門学校→（昭和薬科大学）
1930年 共立女子薬学専門学校→（共立薬科大学）→（慶應義塾大学薬学部）
1931年 東京薬学専門学校女子部→→（東京薬科大学）
1932年 神戸女子薬学専門学校→（神戸薬科大学）
1939年 東北薬学専門学校→（東北薬科大学）
1941年 星製薬専門学校→（星薬科大学）
外地
京城薬学専門学校（ソウル大学校薬学大学）
詳細は旧制医学専門学校を参照
旧制高等学校医学部系
第一高等学校医学部→千葉医学専門学校→千葉医科大学に吸収され廃止
第二高等学校医学部→仙台医学専門学校→東北帝国大学医学専門部→廃止 後継：東北帝国大学医科大学
第三高等学校医学部→岡山医学専門学校→岡山医科大学に吸収され廃止
第四高等学校医学部→金沢医学専門学校→金沢医科大学に吸収され廃止
第五高等学校医学部→長崎医学専門学校→長崎医科大学に吸収され廃止
戦時体制の中で、医者の確保のために設置され、各大学の医学部と臨時附属医学専門部（のちに附属医学専門部と改称）とは並立していた。附属医学専門部は戦後に廃止され、医学部のみが存続した。
帝国大学
北海道帝国大学臨時附属医学専門部（北海道大学医学部に吸収され廃止）
東北帝国大学臨時附属医学専門部（東北大学医学部に吸収され廃止）
東京帝国大学臨時附属医学専門部（東京大学医学部に吸収され廃止）
名古屋帝国大学臨時附属医学専門部（名古屋大学医学部に吸収され廃止）