代内閣期間首班与党
75宇野内閣1989年6月3日 - 1989年8月10日宇野宗佑自由民主党
76第1次海部内閣1989年8月10日 - 1990年2月28日海部俊樹自由民主党
77第2次海部内閣1990年2月28日 - 1990年12月29日自由民主党
改造内閣1990年12月29日 - 1991年11月5日
78宮澤内閣1991年11月5日 - 1992年12月12日宮澤喜一自由民主党
改造内閣1992年12月12日 - 1993年8月9日
79細川内閣1993年8月9日 ‐ 1994年4月28日細川護熙日本新党・日本社会党・新生党・公明党・新党さきがけ・民社党・社会民主連合・民主改革連合（参院）
80羽田内閣1994年4月28日 ‐ 1994年6月30日羽田孜新生党・日本新党・民社党・自由党・公明党・社会民主連合・改革の会
閣外協力：新党さきがけ
81村山内閣1994年6月30日 ‐ 1995年8月8日村山富市日本社会党・自由民主党・新党さきがけ
改造内閣1995年8月8日 - 1996年1月11日
82第1次橋本内閣1996年1月11日 - 1996年11月7日橋本龍太郎自由民主党・日本社会党/社会民主党・新党さきがけ
83第2次橋本内閣1996年11月7日 - 1997年9月11日自由民主党
閣外協力：社会民主党・新党さきがけ
改造内閣1997年9月11日 - 1998年7月30日自由民主党
閣外協力：社会民主党・新党さきがけ（1998年6月まで）
84小渕内閣1998年7月30日 ‐ 1999年1月14日小渕恵三[13]自由民主党
第1次改造内閣1999年1月14日 - 1999年10月5日自由民主党・自由党
第2次改造内閣1999年10月5日 - 2000年4月5日自由民主党・自由党・公明党
85第1次森内閣2000年4月5日 - 2000年7月4日森喜朗自由民主党・公明党・保守党
86第2次森内閣2000年7月4日 - 2000年12月5日自由民主党・公明党・保守党
改造内閣
(省庁再編前)2000年12月5日 - 2001年1月6日
改造内閣
(省庁再編後)2001年1月6日 - 2001年4月26日
87第1次小泉内閣2001年4月26日 - 2002年9月30日小泉純一郎自由民主党・公明党・保守党
第1次改造内閣2002年9月30日 - 2003年9月22日自由民主党・公明党・保守党/保守新党
第2次改造内閣2003年9月22日 - 2003年11月19日自由民主党・公明党・保守新党
88第2次小泉内閣2003年11月19日 - 2004年9月27日自由民主党・公明党
改造内閣2004年9月27日 - 2005年9月21日
89第3次小泉内閣2005年9月21日 - 2005年10月31日自由民主党・公明党
改造内閣2005年10月31日 - 2006年9月26日
90安倍内閣2006年9月26日 - 2007年8月27日安倍晋三自由民主党・公明党
改造内閣2007年8月27日 - 2007月9月26日
91福田康夫内閣2007年9月26日 -福田康夫自由民主党・公明党

注釈^ 黒田内閣総辞職に際し、明治天皇は黒田の辞表のみを受理。他の閣僚は留任させ、内大臣三條實美に内閣総理大臣を兼任させた。天皇があらためて山縣有朋に組閣の大命を下したのは二ヵ月も経ってからだったため、この間は一つの内閣が存在したものとして、かつては「三條暫定内閣」と呼んでいた。ただし今日では慣例として、これを歴代の内閣には数えていない。
^ 1896年8月31日‐9月18日の間、黒田清隆枢密院議長が臨時兼任。
^ 1901年5月10日‐6月2日の間、西園寺公望枢密院議長が臨時兼任。
^ 1921年11月4日‐11月13日の間、内田康哉[[外務大臣 (日本)|]]が臨時兼任。
^ 1923年8月24日‐9月2日の間、内田康哉外務大臣が臨時兼任。
^ 1924年6月11日に成立した加藤高明の護憲三派内閣は、連立が崩壊したためいったん総辞職。加藤はあらためて組閣の大命を受け、1925年8月2日憲政会単独の内閣を組織した。