美濃地方
県南部。およそ旧美濃国部分に相当する。
美濃地方を西濃・岐阜・中濃・東濃などと区分する場合もある。（地域参照）
流通、産業など愛知県（名古屋市）との関係が色濃い。
飛騨地方
県北部。およそ旧飛騨国部分に相当する。
飛騨地方北部は日本海側に近く、流通、産業など富山県との関係が色濃い。
日本では数少ない内陸県のひとつであり、その地形は変化に富んでいる。
北部の飛騨地方の大部分は、標高3000メートル級の飛騨山脈をはじめとする山岳地帯であり、平地は高山盆地などわずかである。一方、南部の美濃地方は、愛知県の伊勢湾沿岸から続く濃尾平野が広がり、低地面積が広い。特に南西部の木曽三川（木曽川、長良川、揖斐川）合流域とその支流域には、水郷地帯が広がり、海抜0メートル以下の場所も存在する。この地域には水害から身を守るための輪中と呼ばれる堤防で囲まれた構造あるいはその集落がある。このような岐阜県の地形の特徴を表して、飛山濃水という言葉がある。
岐阜県の河川は6つの水系からなる。飛騨地方北部は日本海へと注ぐ神通川水系および庄川水系流域、飛騨地方南部は太平洋に注ぐ木曽川水系流域である。美濃地方の河川は大部分が太平洋へと注ぐ。西濃・岐阜・中濃地方と東濃地方北部は木曽川水系流域、東濃地方南部は、庄内川水系および矢作川水系流域である。なお、旧越前国である郡上市白鳥町石徹白地区は日本海へと注ぐ九頭竜川水系流域である。
各県との県境は、ほとんどが山地山脈である。ただし、愛知県尾張地方との県境の大部分および三重県との県境の一部は、木曽川、長良川、揖斐川などの河川が県境となっている。
主要な河川
太平洋へ注ぐ河川
木曽川水系
木曽川（主な支流として付知川、阿木川、飛騨川、可児川）
長良川（主な支流として吉田川、板取川、武儀川、津保川、伊自良川、境川）
揖斐川（主な支流として坂内川、粕川、根尾川、牧田川）
庄内川水系 庄内川（岐阜県内は土岐川と呼ばれる）
矢作川水系 矢作川（主な支流として上村川、明智川）
日本海へ注ぐ河川
神通川水系 神通川（岐阜県内は宮川と呼ばれる）（主な支流として高原川）
庄川水系 庄川
九頭竜川水系 石徹白川
主要な山岳
飛騨山脈（北アルプス） 穂高岳、槍ヶ岳、焼岳、乗鞍岳、笠ヶ岳、御嶽山など
木曽山脈（中央アルプス） 恵那山など
両白山地 白山、大日ヶ岳、能郷白山、冠山など
飛騨高地 位山、籾糠山など
