城ヶ島を含む三崎一帯は江戸幕府の直轄地（天領）となる。慶長年間に三崎御番所が置かれ、三崎代官（一時、三崎奉行）によって統治された（初代代官：長谷川長綱）。

1648年：三崎奉行設置。同奉行安部次郎兵衛が島東端の安房崎に烽火台を設置。

1649年：城ヶ島で海老網漁が始まる。

1676年：衣笠庄三崎郷が分割され、城ヶ島村となる。

1678年：烽火台を島西部に移設して灯明台を設置。

1681年：州の御前で雨乞いが行われる。

1696年：三崎奉行廃止、浦賀奉行所の所管下で再び三崎代官を設置、平岡三郎衛門が任官。

1721年：三崎代官河原清兵衛、灯明台を篝火に変更する。

1808年：城ヶ島の大火。浦賀奉行岩本正倫、砲台を設置。

1810年：幕府、会津藩主松平容衆に相模海防役を命じる。

1811年：会津藩、城ヶ島砲台を修理して遠見番所を併設。城ヶ島を含む三崎一帯の領主となる。

1812年：会津藩、安房ヶ崎にて大砲発射演習を行う。浦賀の加藤山寿が『三浦古尋録』を著す。

1821年：幕府、会津藩の相模海防役を解き、代わって川越藩が同役に就く。城ヶ島砲台は浦賀奉行の所管となる。

1841年：『新編相模国風土記稿』成立。

1854年：三崎の名主吉兵衛、城ヶ島沖に異国船2隻を発見、上宮田陣屋に報告。

1856年：遠見番所廃止。

1867年：幕府によって灯台建設が計画される。

1868年：三崎一帯は韮山代官江川太郎左衛門の監督下に置かれる。

明治

1868年：城ヶ島を含む三浦は韮山県に属す。

1870年：城ヶ島灯台初点。

1871年：神宮寺跡、廃地となる。廃藩置県により神奈川県に属す。

1873年：城ヶ島学舎が常光寺に開校。

1875年：城ヶ島灯台、緑色光となる。城ヶ島村、三崎町に合併。

1877年：城ヶ島海南神社、宮ヶ崎から現地に移動。

1881年：城ヶ島学校新築。

1888年：城ヶ島学校、宮ヶ崎に新築。

1889年：町村制施行、城ヶ島は三崎町となる。初代町長は最後の城ヶ島村名主であった加藤泰次郎。

1894年：臨時東京湾守備隊司令部（後の東京湾要塞司令部）が設置され、三崎に監視哨を置く。

1898年：勅令第百七十六号「要塞近傍ニ於ケル水陸測量等ノ取締ニ関スル件」公布。要塞近傍における測量・模写・撮影には要塞司令官の許可が必要となる。

1899年：軍機保護法、要塞地帯法公布。城ヶ島を含む三浦半島全域が要塞地帯に指定。制限事項は漁業活動、土木・建築等に拡大。

1905年：海軍、城ヶ島に望楼設置。水難救済会、赤羽根に見張所設置。

1911年：城ヶ島学校、小網代学校と共に三崎学校に合併、分校となる。

大正

1913年：北原白秋、『城ヶ島の雨』発表。

1919年：北原白秋、『城ヶ島の雨』を『白秋小唄集』に収録、刊行。

1923年：関東大震災により城ヶ島灯台倒壊。

1924年：東京湾要塞復旧建設要領策定により、城ヶ島への砲台新設が決定。東京湾要塞城ヶ島砲台起工（10月12日）。

昭和

1927年：城ヶ島灯台再建。東京湾要塞城ヶ島砲台竣工（4月2日）。

1928年：城ヶ島に電灯が灯る。灯台の光度も2万燭光から12万燭光となる。

1931年：三崎尋常小学校城ヶ島分教場設置。

1936年：城ヶ島の大火。

1945年：城ヶ島砲台廃止、要塞砲を破壊処理。

1947年：三崎尋常小学校城ヶ島分教場を三崎小学校城ヶ島分教場と改称。

1949年：『城ヶ島の雨』歌碑完成。

1950年：旧軍用地約17 ha を都市計画公園に決定。映画『城ヶ島の雨』（監督：田中重雄）公開。

1953年：県営埋立着工（北岸西側、観光船発着場周辺）

1955年：三崎町、南下浦町、初声村が合併、三浦市となる。三崎小学校城ヶ島分教場を三崎第一小学校城ヶ島分校と改称。

1956年：西山地区の埋立竣工。

1957年：城ヶ島大橋着工。

1958年：県立城ヶ島公園設置。城ヶ島保育園開園。

1959年：映画『城ヶ島の雨』（監督：猪俣勝人）公開。

1960年：城ヶ島大橋竣工、開通。遊ヶ崎埋立着工。

1962年：安房崎灯台初点、県営埋立竣工（北岸東側、現在の新潟造船一帯）、城ヶ島ユースホステル開館。

1963年：城ヶ島?油壺（京急油壺マリンパーク）間に定期観光船が就航。

1964年：神奈川県水産試験場設置。

1966年：皇太子明仁親王（今上天皇）、神奈川県水産試験場に御来訪。

1970年：三崎小学校城ヶ島分校廃校（城ヶ島公民館に転用）。