2008年度の学部入学者2,901人中、出身高校所在地別入学者比率は、近畿地方が57.7%と最も多く（大阪府18.8%、兵庫県12.3%、京都府10.4%）、以下、中部地方14.5%、関東地方8.7%、九州・沖縄地方6.7%、中国地方6.5%、四国地方3.3%、東北地方1.4%、北海道1.1%となっている（→帝国大学#入学状況）。
他の旧帝国大学では、大学が所在する都道府県からの入学者が最も多いが、京大では京都府出身者が3番目であり、唯一そのようになっていないという特徴がある。
学部
総合人間学部
総合人間学科
人間科学系
国際文明学系
文化環境学系
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自然科学系
文学部
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西洋哲学史専修
古代哲学史専攻
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キリスト教学専修
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中国哲学史専修
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仏教学専修
西洋文化学系
西洋古典学専修
スラブ語学スラブ文学専修
ドイツ語学ドイツ文学専修
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アメリカ文学専修
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西洋史学専修
考古学専修
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心理学専修
言語学専修
社会学専修
地理学専修
基礎現代文化学系
科学哲学科学史専修
情報・史料学専修
二十世紀学専修
現代史学専修
教育学部
教育科学科
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相関教育システム論系
法学部
学科組織無し
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公法学系
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政治学学系
経済学部
経済学科
経営学科
理学部
理学科
数学系
物理・宇宙物理学系
地球惑星科学系
化学系
生物科学系
医学部
医学科（6年制）
保健学科
看護学専攻
検査技術科学専攻
理学療法学専攻
作業療法学専攻
薬学部
総合薬学科（4年制、平成17年度入学者まで）
薬学科（6年制、平成18年度入学者以降）
薬科学科（4年制、平成18年度入学者以降）
工学部
地球工学科
建築学科
物理工学科
電気電子工学科
情報学科
工業化学科
農学部
資源生物科学科
応用生命科学科
地域環境工学科
食料・環境経済学科
森林科学科
食品生物科学科
大学院
文学研究科
文献文化学専攻
思想文化学専攻
歴史文化学専攻
行動文化学専攻
現代文化学専攻
教育学研究科
教育科学専攻
臨床教育学専攻
法学研究科
法政理論専攻
法曹養成専攻（専門職学位課程、法科大学院）
経済学研究科
経済システム分析専攻
経済動態分析専攻
現代経済・経営分析専攻（2006年度より現代経済学専攻とビジネス科学専攻を再編）
理学研究科
数学・数理解析専攻
物理学・宇宙物理学専攻
地球惑星科学専攻
化学専攻
生物科学専攻
医学研究科
医学専攻（4年制博士課程）
医科学専攻（修士課程・博士後期課程）
社会健康医学系専攻（専門職学位課程、公衆衛生大学院・博士後期課程）
人間健康科学系専攻
薬学研究科
創薬科学専攻
生命薬科学専攻
医療薬科学専攻
医薬創成情報科学専攻
工学研究科
社会基盤工学専攻
都市社会工学専攻
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原子核工学専攻
材料工学専攻
電気工学専攻
電子工学専攻
材料化学専攻
物理工学専攻
物質エネルギー化学専攻
分子工学専攻
高分子工学専攻
合成・生物化学専攻
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農学研究科
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人間・環境学研究科
共生人間学専攻