テロ・ゲリラ闘争は、世論の猛烈な指弾を受け、警察の取り締まりと孤立化を強める結果となった。近年は若手獲得とこれ以上の孤立化を防ぐため、テロ・ゲリラ等を控えて、組織拡大に重点を置き、市民運動や労働組合、ワーキングプア層への浸透を図る戦術を採っている。これは1991年に中核派が「将来の武装闘争に備えてテロ・ゲリラ戦術を堅持しつつも、当面は武装闘争を控え、大衆闘争を基軸に党建設を重視する」との方針を決めた「五月テーゼ」（03年以降は「新指導路線」と呼んでいる）に基づいた戦術である。ここで注意しなければいけないのは組織拡大とは単に同派の同盟員を増やすことだけではなく、同派と関連がある労組・団体（影響の程度は団体によってかなり異なる）の拡大や設立、かつてはほとんど関係がなかった団体との交流による影響力拡大も含まれることである。労働運動の分野では自治体、郵政、教育、JRを「四大産別」として、労組への影響力拡大を図っている。また、毎年11月頃に「全国労働者総決起集会」を東京で開催しており、その動員数は年々増加傾向にある。2005年の「11.6全国労働者総決起集会」では過去最高の2700人を動員した（ ⇒平成17年の警備情勢を顧みてより）。歴史教科書問題では、2005年、新しい歴史教科書をつくる会が執筆した扶桑社発行の 教科書採択反対運動に積極的に介入し、東京都杉並区などで激しい反対運動を起こしている。東京都杉並区、神奈川県相模原市、大阪府泉佐野市、高槻市、八尾市の議会には中核派系の議員がおり、議会への進出度は日本労働党と並び、日本の新左翼の中では屈指。東京都知事選で青島幸男、国政選挙で社会民主党（個人では大田昌秀ら）、9条ネットのZAKIを支持、中核派系政治団体「都政を革新する会」の長谷川英憲を支援した。長谷川は、1989年の東京都議選で当選しており、これは新左翼では史上初の都道府県議員であった。

2006年、労組内の主導権を重視する「労働戦線派」（多数派、安田・中野一派とも）と、これまでの路線を踏襲し各方面での大衆運動に関わることを重視する「諸戦線派」（少数派、塩川一派とも）の対立から、関西や九州などで「諸戦線派」に対する排除あるいは離脱などの内部対立が表面化した。同年に現役杉並区議2名も、議会闘争方針の対立から中核派の政治団体「都政を革新する会」から離脱し、「無所属区民派」を結成した。さらには運動の進め方を労働戦線に集中して、部落解放闘争を労働戦線の付随とするような運動方針をめぐって、これまで共闘関係にあった部落解放同盟全国連合会（全国連）とも関係が悪化し、2008年2月には全国連から「広島差別事件」として糾弾を受ける立場になった。中核派はこの問題において、糾弾を受けた2月時点では沈黙していたが、4月になって全国連を「塩川一派」と規定して機関紙で公然と批判し始め、公式サイトから全国連サイトへのリンクを削除しているなど、その対立の溝は拡大し始めている。更に杉並では都革新と無所属区民派の間で裁判沙汰となったり、中央に批判的な革共同関西地方委員会が独自に機関誌「展望」を発刊し執行部批判を展開するなど、泥沼の様相を見せている。

年表

1959年
8月 革命的共産主義者同盟から分裂し結成される（革共同第2次分裂）。

1962年
9月 議長・黒田寛一派と書記長・本多延嘉派の対立が表面化する。

1963年
2月 黒田派が分裂して日本革命的共産主義者同盟革命的マルクス主義派（革マル派）を結成し、本多派は執行部を抑える（革共同第3次分裂）。

1970年
8月4日 東京教育大学（現・筑波大学）の学生だった革マル派の海老原俊夫を法政大学構内で襲撃し、殺害する。

1973年
3月 対革マル戦争の路線対立で政治局員・田川和夫が除名。9月 部落問題をめぐる意見の対立から沢山保太郎が除名。

1974年
2月6日 琉球大学構内で、一般学生・比嘉照邦さんを「革マル派メンバー」と誤認して殺害する。

1975年
3月14日 書記長・本多延嘉が革マル派に殺害される。

1980年
対革マル戦争を担いロンドンに亡命していた上口孝夫が帰国し、正統本多派と称して「『勝利に向っての試練』編集委員会」（試練派）を立ち上げ、中核派から分裂した。（後に試練派は1983年、第四インターに近づくが失敗し、86年に「第四インターナショナル・ボルシェヴィキ派（準備委員会）」（ボル派）を結成し、機関誌『ボルシェヴィキ』を創刊した）

1983年
3月8日 主に「一坪再共有化運動」の是非をめぐって三里塚・芝山連合空港反対同盟が分裂。「再共有化運動」に反対した中核派は、「北原派」を支持する。

1984年
1月 全国一斉に五箇所の第四インター派メンバー宅を襲撃。一人に頭蓋骨陥没させる重傷を負わせる。7月 全国一斉にふたたび三箇所の第四インター派メンバー宅を襲撃。一人に片足切断の重傷を負わせる。9月19日 中核派の地下軍事組織である「人民革命軍」が、火炎放射器で自由民主党の本部を襲撃。本部ビルの一部を焼失させる。（詳細は自由民主党本部放火襲撃事件の項を参照）

1985年
10月20日 三里塚交差点付近で、丸太、鉄パイプ、火炎瓶などを武器に、機動隊と大規模衝突を起こす（10.20成田現地闘争）。11月29日 首都圏・大阪地区の国電運転線区で同時多発的に通信ケーブルを切断。さらに、浅草橋駅を占拠し、放火。（詳細は国電同時多発ゲリラ事件の項を参照）。

以降、街頭実力闘争は行っていない。

1986年
4月15日 在日米軍の横田飛行場を狙って、車の荷台から「迫撃弾」と称した金属の塊5個を射ち込む。