父は元々は哲学や歴史を修めるために大学に行ったが、途中から音楽家に転じたという経歴を持つ、ザルツブルクの宮廷作曲家、ヴァイオリニストであったレオポルト・モーツァルト（Leopold Mozart）、母はアンナ・マリーア・ペルトル（Anna Maria Pertl）、姉はマリーア・アンナ（Maria Anna Mozart、愛称ナンネル（Nannerl））である。なお、祖先の姓はモッツハルト（Motzhardt）。
モーツァルトは妻・コンスタンツェ（Constanze, 1762年 - 1842年）との間に4男2女をもうけたが当時は医学が発達した時代ではなかったため、そのうち成人したのはカール・トーマス（Karl Thomas）とフランツ・クサーヴァー（Franz Xaver）だけで、残りの4人は乳幼児のうちに死亡している。フランツは職業音楽家となり、「モーツァルト2世」を名乗った（フランツは弟子のジュースマイヤーの名であり、このためフランツ・クサーヴァーはモーツァルトの実子ではなく、妻・コンスタンツェとジュースマイヤーとの婚外子という説がある）。成人した2人の男子はどちらも子どもを残さなかったため、モーツァルトの直系の子孫はいない。
1756年、ザルツブルクに生まれる。父・レオポルトは息子が天才であることを見出し、幼少時から音楽教育を与えた。父とともに音楽家としてザルツブルク大司教ヒエロニュムス・コロレド伯の宮廷に仕える一方でモーツァルト親子は何度もウィーン、パリ、ロンドン、およびイタリア各地に大旅行を行った。これは神童の演奏を披露したり、よりよい就職先を求めたりするためであったが、どこの宮廷でも就職活動に失敗する。
1781年、25歳のモーツァルトはザルツブルクを出てウィーンに定住。フリーの音楽家として演奏会、オペラの作曲、レッスン、楽譜の出版などで生計を立てた。ウィーンではピアニストとして人気を誇ったが、晩年までの数年間は収入が減り、借金を求める手紙が残されている。1791年、ウィーンでレクイエムの作曲中に35歳の若さで没した。
年譜
1756年 - （0歳） 1月27日、ザルツブルクに生まれる。
1759年 - （3歳） クラヴィーア（ピアノの前身）を弾き始める。
1761年 - （5歳） 最初の作曲を行う（『アンダンテ ハ長調 K.1a』）。
1762年 - （6歳）
1月、ミュンヘン旅行。
9月、ウィーン旅行（10月13日、シェーンブルン宮殿にてマリア・テレジア御前演奏。