引退した航空会社
アメリカン航空（-SPと-100をDC-10とMD-11へ置き換えた）
アリタリア航空（-200をボーイング777へ置き換えた）
エジプト航空（-300をボーイング777・エアバスA340へ置換えた）
コンチネンタル航空（-100をボーイング777へ置き換えた）
デルタ航空（-100をL-1011へ置き換えた）
パンアメリカン航空（破産）
スイス航空（-300をエアバスA340へ置換えた）
スカンジナビア航空（-100をDC-10-30へ置き換えた）
イラク航空（湾岸戦争以後バグダード国際空港で地上保管されているが、そのまま用途廃棄になる予定である）
エア・マダガスカル（-200をエアバスA340に置き換えた）
アビアンカ・コロンビア航空（-200をボーイング767-300ERへ置き換えた）
エア・カナダ（-400をエアバスA340・ボーイング777-200ERへ置換えた）
ロイヤル・ヨルダン航空（A340へ置き換えた）
ヴァリグ・ブラジル航空（-200C/-300/-400をMD-11とボーイング777-200ERへ置き換えた）
アルゼンチン航空（-200/-SPをエアバスA340へ置換えた）
※=シンガポールの新興貨物航空会社へ譲渡予定。譲渡後もNCAが全面協力する。
この機の特性を生かして、団体客をその主なターゲットとした多くのチャーター専門会社や中古機を利用した貨物専用会社が747（主に中古機）を保有・使用している。
ワールドエアウェイズ（売却後長らく保有していなかったが、このほど-400BDSFを導入したことから同機の保有が復活した[4]）
ネーションエア・カナダ（現存しない）
エア・アトランタ・アイスランディック
エア・アトランタ・ヨーロッパ
プーケット航空
オリエント・タイ航空
MKエアラインズ
エヴァグリーン・インターナショナル・エアーラインズINC
カリッタ・エアINC
特徴ある747スペースシャトルを輸送中のNASA所有747-100改造機
米国
N7470
ボーイング747生産第一号機。生産地を称えてシティ・オブ・エバレットの愛称が付けられている。現在は静態保存状態でエンジンも取り外されている。
N747PA
747初の世界商業フライトに投入されたクリッパーアメリカ（パンアメリカン航空）。1971年 にボーイング747初の人身事故を起こしている。
N601AA,N602AA
アメリカン航空が待望の太平洋線就航のために購入した747SP-31。
N905NA
NASAがスペースシャトルを輸送する目的でアメリカン航空から購入した機体。購入後は暫くのあいだAALの塗装のままで飛んでいたが、現在はNASAのフルカラー機。アメリカン航空時代はN9668。
N911NA
NASAがチャレンジャーの事故を受けて1988年に日本航空から購入した機体。こちらはすぐにNASAの正式塗装となった。元JA8117で日本航空の747SR1号機でもあった。
N93102
トランスワールド航空の機材の中では唯一ニックネームシティ・オブ・パリスを持っていた。1975年にイラン空軍へ譲渡。
N601BN
ブラニフ航空の初号機だったが、倒産で放出ののちタワーエア社へ売却した。（→N601FF、1994年解体）
N4719U
ユナイテッド航空待望の国際線成田初便に使用された機材フレンドシップ・ジャパン。
N631FE
唯一のフェデックス(FEDERAL EXPRESS)フルカラー機。その後サザンエアトランスポート(N742SJ)を経てポーラエアカーゴ(N806FT)が購入。
N644NW
ノースウエスト・カーゴの機体に書かれたセレクト・3スピード・サービス。元シンガポール航空9V-SKQ。
N521UP
オリンピック特別協賛塗装(UPS)、元シンガポール航空9V-SQS。
N517MC
アトラスエア機材で唯一のSAS塗装だった
N408MC
アトラスエア機材でエミレーツ航空・スカイカーゴ塗装。
N196UA
ユナイテッド航空新塗装初号機
N783SJ
サザンエア社フリートで唯一NCAカラーを纏っている。元JA8188。
N740WA
ワールド航空で導入した-400BDSF。
N570UP
UPSでは初号機の-400F。
日本航空
JA8101
日本航空747第一号機。1992年の引退まで旅客機として運用された。
JA8103→N703CK
3号機。日本航空→日本アジア航空。映画「エアフォースワン」の撮影用機体。
JA8107
7号機。日本航空の機材の中ではいち早く貨物用へ転用された機体。成田開港前時点ではすでに転用済。転用後も客室窓が埋められていなかった。
JA8109
1973年に発生した日本赤軍らによるドバイ日航機ハイジャック事件において、日本航空機で唯一テロリストに爆破され、活躍が1年弱と短命だった機体。同機の尾翼は比較的状態が良かったため、KLMオランダ航空に売却された。
