日本では「山の中に女が入ると、女神である山の神の嫉妬に遭い事故が起こる」という迷信が長らく信じられてきた。そのためトンネルや坑道などへの立ち入りは長らく女人禁制であった。また、実際トンネル工事は危険が伴うこともあり、労働基準法第64条の2項において女性のトンネル建設への従事など坑内労働を禁じている。この規定は男女雇用機会均等法などの流れの中でも見直されないままであったが、2005年になって、ようやく国によるこの規制の見直しについて検討が始まった[2]。しかし、縁起を重んじる工事現場からの反発も予想される。
また、しばしばトンネルは怪談や都市伝説の舞台になる。その中で、工事中あるいは開通後の事故で死んだ人の亡霊が現れる、といったたぐいである。有名なところでは、石北本線常紋トンネルにおいてはいわゆる「タコ部屋労働」が原因であるとして、また肥薩線第二山の神トンネルにおいてはそこで発生した乗客轢死事故が原因であるとして亡霊話がしばしば語られる。
なお、トンネル建設工事に従事する労働者の労働者災害補償保険保険料率は業種別で最高となる 11.8 % が適用される。これは同じ土木工事である道路新設事業 2.1 % の5倍以上の料率であり、トンネル建設工事の危険性が高いことを示している。
なお、トンネルの貫通の際に採取された石を貫通石（かんつうせき）といい、お守りとして用いられる。最近では各高速道路会社などが販売することもある。
主な鉄道トンネル一覧（国内）トンネル事業者線区全長備考
新登川トンネルJR北海道石勝線5,825m
新狩勝トンネルJR北海道根室本線5,790m
青函トンネルJR北海道海峡線53,850m
津軽トンネルJR北海道海峡線5,880m
八甲田トンネルJR東日本東北新幹線26,455m建設中（ただし貫通済み）
岩手一戸トンネルJR東日本東北新幹線25,808m
福島トンネルJR東日本東北新幹線11,705m
蔵王トンネルJR東日本東北新幹線11,215m
清水トンネルJR東日本上越線（上り）9,702m
新清水トンネルJR東日本上越線（下り）13,500m
大清水トンネルJR東日本上越新幹線22,221m
榛名トンネルJR東日本上越新幹線15,350m
中山トンネルJR東日本上越新幹線14,857m
魚沼トンネルJR東日本上越新幹線8,625m
飯山トンネルJR東日本北陸新幹線22,225m建設中
六十里越トンネルJR東日本只見線6,359m
仙山トンネルJR東日本仙山線5,361m
仙台トンネルJR東日本仙石線地下区間（広義の地下鉄）
仙岩トンネルJR東日本（秋田新幹線）、田沢湖線3,915m
押角トンネルJR東日本岩泉線2,987m
樽沢トンネルJR東日本吾妻線7.2m日本一短い鉄道トンネル
東京トンネルJR東日本横須賀線（所属は東海道本線）
総武本線9,532m地下区間（広義の地下鉄）
笹子トンネルJR東日本中央本線上り4,656m
下り4,670m
塩嶺トンネルJR東日本中央本線5,994m
丹那トンネルJR東海東海道本線7,841m熱海側の一部区間はJR東日本に属する
新丹那トンネルJR東海東海道新幹線7,959m
日本坂トンネルJR東海東海道新幹線2,174m
大原トンネルJR東海飯田線5,063m
北陸トンネルJR西日本北陸本線13,870m
頸城トンネルJR西日本北陸本線11,353m
六甲トンネルJR西日本山陽新幹線16,250m
安芸トンネルJR西日本山陽新幹線13,000m
関門トンネルJR九州山陽本線3,614m
新関門トンネルJR西日本山陽新幹線18,713m
長崎トンネルJR九州長崎本線6,173m
真崎トンネル三陸鉄道北リアス線6,532m
赤倉トンネル北越急行ほくほく線10,472m