他の甲虫類同様、前翅はとても硬く柔らかい部分を守る働きもしている。鞘のように後胸・腹部や後翅を覆っているため、上翅（じょうし）或いは鞘翅（しょうし）ともいう。
飛行時には前翅を開き、後翅に血液を通し広げて飛ぶが、大型種の場合飛ぶのは至極不器用で、また柔らかい部分が剥き出しになるため鳥に狙われやすい。あまり飛ばない種も多いが、翅が退化してしまっているわけではない。このような種は灯火やバナナトラップなどに集まりにくいため、ルッキングでの採集が基本となる。
飛行後、後翅をうまく畳めなくなってしまい、前翅からはみ出た状態になったり、前翅自体がきちんと閉まらなくなることがある。これは飼育下で狭いケースに入れられたクワガタムシが飛ぼうとしたときにも起りやすく、俗にはねパカという。この場合、後翅が何かに引っかかって状態が悪化することがよくある。
その他の器官
口器
口器はブラシ状になっており、上下左右に分かれている。下唇基節に収納することができる。口器は樹液や果液を吸う時は左右に動くが、メスが動物性タンパク質を摂取する時は上下に動いて、虫などを噛み砕く事ができる。
触角
基本的に10節に分かれ、根元から数えて第一節は長く、第二節との間で曲げることができる。これがクワガタムシ科と他の科を識別する要素のひとつになっている。
クワガタムシ亜科 Lucaninae
ミヤマクワガタ属 Lucanus - ミヤマクワガタ・ヨーロッパミヤマクワガタ・カンターミヤマクワガタ ミクラミヤマクワガタ オーベルチュールミヤマクワガタ ミヤマクワガタ アマミミヤマクワガタ
オオクワガタ属 Dorcus - オオクワガタ・ヒメオオクワガタ・ヒラタクワガタ・コクワガタ・アンタエウスオオクワガタ・オオヒラタクワガタ・アルキデスヒラタクワガタ アカアシクワガタ サワイコクワガタ ネパレンシス
ノコギリクワガタ属 Prosopocoilus - ハチジョウノコギリクワガタ
コツノノコギリクワガタ属 Aphanognathus
オニクワガタ属 Prismognathus - オニクワガタ・キンオニクワガタ
ヒメオニクワガタ属 Cladophyllus
カンギアヌスオニクワガタ属 Eligmodontus
トリアピカルスオニクワガタ属 Gonometops
シカツノオニクワガタ属 Capreolucanus - シカツノオニクワガタ
オウゴンオニクワガタ属 Allotopus
ツヤクワガタ属 Odontolabis - アルケスツヤクワガタ・ラコダールツヤクワガタ・フェモラリスツヤクワガタ
ホソクワガタ属 Leptinopterus
クビホソツヤクワガタ属 Cantharolethrus
ホソアカクワガタ属 Cyclommathus - メタリフェルホソアカクワガタ・エラフスホソアカクワガタ、インペラトールホソアカクワガタ、アラガールホソアカクワガタ
マルバネクワガタ属 Neolucanus - アマミマルバネクワガタ・チャイロマルバネクワガタ・マキシムマルバネクワガタ
フタマタクワガタ属 Hexarthrius - パリーフタマタクワガタ・ブケットフタマタクワガタ・マンディブラリスフタマタクワガタ、フォルスターフタマタクワガタ
シカクワガタ属 Rhaetulus - ディディエールシカクワガタ・スペキオススシカクワガタ
オオシカクワガタ属 Rhaetus - ウェストウッディーオオシカクワガタ
クロツヤシカクワガタ属 Pseudorhaetusチュウゴククロツヤシカクワガタ
ベトナムシカクワガタ属 Weinreichiusペロティシカクワガタ
メンガタクワガタ属 Homoderus - メンガタクワガタ・グラディアトールメンガタクワガタ
ヌエクワガタ属 Katsuraius
オオツヤクワガタ属 Mesotopus - タランドゥスオオツヤクワガタ・レギウスオオツヤクワガタ
チリクワガタ属 Chiasognathus - チリクワガタ
シワバネクワガタ属 Sphaenognathus
ハイイロクワガタ属 Cacostomus - ハイイロクワガタ
コフキクワガタ属Casignetus - フンボルトコフキクワガタ
ハワイハネナシクワガタ属 Apterocyclus - ハワイハネナシクワガタ
チリハネナシクワガタ属 Apterodorcus - チリハネナシクワガタ
ネブトクワガタ属 Aegus - ネブトクワガタ・アンプルスネブトクワガタ
ニセネブトクワガタ属 Aegognathus
ヒサゴネブトクワガタ属 Aegotypus
サビクワガタ属 Gnaphaloryx
キバサビクワガタ属 Eulepidius
ヒサゴサビクワガタ属 Bartolozziolucanus
インフラトゥスサビクワガタ属 Cherasphorus
パリオロススサビクワガタ属 Tumidaegus
ヒョウモンクワガタ属 Scortizus
インカクワガタ属 Auxicerus
サメハダクワガタ属 Pycnosiphorus
ムネツノクワガタ属 Sclerostomus
オノレクワガタ属 Onorelucanus
ギアナクワガタ属 Charagmophorus
コツノクワガタ属 Lissotes
オオコツノクワガタ属 Lissapterus
ヒメコツノクワガタ属 Paralissotes
オオズコツノクワガ属 Geodorcus
カギツノクワガタ属 Heterochthes - カギツノクワガタ・アンダマンカギツノクワガタ
カタハリクワガタ属 Hoplogonus
マルガタクワガタ属 Colophon - プリモスマルガタクワガタ
コツメクワガタ属 Chewlucanus
ルリクワガタ亜科 Platycerinae
ルリクワガタ属 Platycerus - ルリクワガタ・コルリクワガタ・ヨーロッパコルリクワガタ