1918年8月30日、レーニンが会合での演説を終え自動車に乗ろうとしたとき、3発の銃声と共にレーニンは倒れた。そのうちの二発が彼の肩と肺に命中した。レーニンは自分のアパートへ運ばれ、他の暗殺者の存在を恐れ病院への搬送を拒絶した。医者が呼び出されたが銃弾の摘出は危険すぎたので手術は行われなかった。レーニンの容態はどうにか回復したものの、その健康状態はこのときから傾き始めた模様で、この暗殺未遂による負傷が、死因となった脳梗塞に大きく影響したと考えられている。
なお、この時現場にいたエスエル党員ファーニャ・カプランが逮捕され、即決裁判の後処刑されたが、彼女は既に失明同然だったことなどから、犯人は別人だった可能性が高い。いずれにしても、この事件はミルバッハ暗殺と合わせて右翼エスエルを弾圧する口実ともなった。
また、「報復」と称して事件とは無関係の512人もの旧貴族や政治家、軍人が、ただ帝政派であるという理由だけで逮捕、処刑された(→赤色テロ)。
第二インターナショナルは加盟する社会民主主義政党が第一次世界大戦においてそれぞれ自国政府を支持したために瓦解した。再建も試みられたが、ボリシェヴィキは独自に1919年にコミンテルンを創設した。レーニンは社会民主主義政党とのどんな協力も拒否する共産主義政党を「『左翼』小児病」と呼んで批判するとともに、社会民主主義政党が旧来のイデオロギーを捨てずにコミンテルンに加盟しようとする動きを警戒してコミンテルンの加入条件を厳格化した。また、1920年のコミンテルン第二回大会に対して「民族・植民地問題に関するテーゼ」を執筆し、従属民族や植民地の解放と共産主義革命の結合を図った。
革命後の列強による干渉戦争や内戦により、ボリシェヴィキ政権は戦時体制を強いられた（戦時共産主義）。企業は国有化され、農民からは余剰穀物が徴発された。内戦終了後、レーニンは新経済政策(ネップ)と呼ばれる新しい政策を打ちだした。余剰穀物の徴発に代えて食糧税を導入し、税を納めた後の残りは市場で自由に処分することを認めた。一定の範囲内で私的商業も認めた。レーニンはこれを労農同盟の再建として解説する一方、ロシアの現状では資本主義も一歩前進だと主張した。
レーニンは少年時代には既に、権力と癒着し腐敗していたロシア正教会に幻滅、そして自身がマルクス主義的無神論者であったこともあり正教会を反革命の温床とし、資産を強引に供出させたりしていたが、1922年3月にイヴァノヴォ州シューヤで教会財産接収に反対するデモが暴徒化し、死者が出たことに激怒。3月29日にロシア正教会の弾圧を指示し、多数の主教たちを殺害すると共におびただしい財宝などを没収させた。レーニンは後に｢宗教は毒酒である｣と言葉を残している。
これ以降グラスノスチまでイコンを所持する事などは禁止された。同様の弾圧はイスラム教のモスクなどでも起こり、チェーカーによる聖職者の殺害、教会資産の没収が強行された。
詳細はグルジア問題を参照
レーニンは1921年末から健康状態を悪化させ、1922年には何度か発作を起こして職務から離れた。その間、各ソヴィエト共和国をどのように構成するかが問題となり、とりわけグルジアをめぐって党内に対立が起こっていた。1921年2月にグルジア社会主義ソヴィエト共和国が成立して以来、ロシア共産党中央委員会カフカース局がグルジアをアゼルバイジャン・アルメニアとともにザカフカーズ連邦として構成しようとする計画を進めたのに対し、グルジア共産党がグルジアの独立性を主張して抵抗していた。
1922年8月、スターリンは、各ソヴィエト共和国が自治共和国としてロシア連邦共和国に加入する、という「自治化」案を作成した。レーニンはこれを大ロシア排外主義として批判し、ロシア連邦共和国は他の共和国とともにソヴィエト同盟に加入する、という代案を出した。スターリンはレーニンの「民族自由主義」に不満を述べたが、修正案を受け入れ、同年10月のロシア共産党中央委員会総会ではレーニンの代案にそった決議を通過させた。
しかしこの決議ではグルジアはザカフカーズ連邦を通じてソヴィエト同盟に加入することになっていたため、グルジア共産党は拒否し、中央委員会のメンバーが総辞職した。11月にはロシア共産党のオルジョニキーゼが独立派のグルジア共産党員を殴るという事件が起こる。病床にあったレーニンはこれを重大なことと受け止め、オルジョニキーゼやその後ろだてとなっていたスターリンを非難した。12月31日に口述筆記された覚え書きで、彼は「抑圧民族、すなわち、いわゆる『強大』民族にとっての国際主義とは、諸民族の形式的平等をまもるだけでなく、生活のうちに現実に生じている不平等にたいする抑圧民族、大民族のつぐないとなるような、不平等をしのぶことでなければならない」と記した。
この問題をきっかけにレーニンとスターリンの関係は極度に悪化し、レーニンは翌1923年1月4日の覚え書きでスターリンの書記長職からの解任を提案するに至った。3月5日にはトロツキーにグルジア問題への取り組みを依頼し、3月6日にグルジアの反対派に向けて「あなたがたのために覚え書きと演説を準備中です」という手紙を口述した。しかし3月10日、彼は発作に襲われ、会話能力を永久に失った。
レーニンは暗殺の試み、戦争と革命の激務によって次第に健康を害していき、1922年5月に最初の発作を起こした。彼の右半身が麻痺した事で政権内における影響力は縮小し、12月の2度目の発作の後に病状が急速に悪化し発狂が疑われたため、政治局は彼に静養を命じた。1923年3月に3度目の発作が起きるとレーニンはもはや話すことも出来ず、ほとんど廃人状態となり、1924年1月21日に4度目の発作を起こし死去した。
レーニンの死因は公式には大脳の動脈硬化症、あるいは脳梗塞とされている。しかし、彼を診察した27人の内科医のうち検死報告書に署名をしたのは8人だった。この事は梅毒罹患説の根拠となったが、実際は署名をしなかった医師は単に他の死因を主張しただけであって、結局この種の説を唱えた医師は一名のみだった（動脈硬化がアテローム性だという事を除いては）。実際、レーニンの父、姉、弟はいずれも脳出血により死去している。
ペトログラードはレーニンにちなんでレニングラードと改名された。また、生地のシンビルスクも彼の本名にちなんでウリヤノフスクと改名された。レニングラードは1991年のソ連崩壊時に元（第一次世界大戦前）の名、サンクトペテルブルクに戻された。但し、同市のある州の名前はレニングラード州のままである。レーニンとスターリン（1922年）ただしこれは合成写真
