シーア派では、アリーがムハンマドから直接後継者に任じられたとし、アブー＝バクル、ウマル、ウスマーンの3代の正統カリフの権威を認めない（彼らを簒奪者であるとして呪詛の対象とすることもある）。そして、指導者として預言者ムハンマドの血を引くことを重視し、ムハンマドの娘ファーティマとアリーとの間に生まれたハサン、フサインの2人をそれぞれ第2代、第3代のイマームとする（シーア派のうちカイサーン派のみは、アリーと別の妻ハウラとの子ムハンマド・イブン・ハナフィーヤを第2代のイマームとする）。一般にハサンやフサインの血統の人々は、特に「シャイフ」や「サイイド」と呼ばれ宗派を問わずムスリム社会では尊敬を受けるが、サイイド自身も預言者の後裔として社会から尊敬を受けるべく身を律するよう求められており、シーア派のみならずサイイド自身がウラマーやスーフィー教団のシャイフなど宗教的職権を担うことも一般的であった。イドリース朝やファーティマ朝、サファヴィー朝のように場合によってはムハンマドの後裔を称する人々が政権を担うことも多くあった。ファーティマ朝はイスマーイール派の信仰規範を整備し、シーア派王朝としての正統性を主張し、サファヴィー朝も神秘主義教団から勃興して十二イマーム派をイラク、イラン全土に浸透させ、現在のイラン周辺のシーア派勢力の基盤を作った。ムハンマドの子女の多くは早世し、ムハンマドの血脈はファーティマを通じてのみ残されたため、ムハンマドの血を引くことはハサンまたはフサインの子孫であることとほぼ同義である。
イスラームの中でもとりわけシーア派においては、ムハンマドは無謬であったとされ、アリーを含めた後継のイマーム達にもその無謬性は受け継がれたと見る。そのためシーア派はスンナ派のハディースの内、アリーがアブー・バクルやウマル、ウスマーンに劣っていたとするハディース等[1]に関して、スンナ派によりアリーからのカリフの位の簒奪を合法化するために偽造されたものとみなす傾向にある。
スンナ派においてもアリーは預言者の娘婿であり義息として、又４代目の正当カリフとして高い尊敬を受けている。（また一部には、彼の息子ハサンを５代目の正統カリフとみなす見解さえある）しかし全体としてアブーバクルやウマル、ウスマーンのカリフ位を認めるスンナ派は、シーア派ほどアリーを高くは見ない傾向にある。
アリーをめぐる伝承と人物像
アリーはアーイシャに対して激しい憎悪を公然と表していたことで知られる。駱駝の戦いの後アーイシャ側についたバスラ市民に対して『お前たちはその女（アーイシャ）の兵隊、四足獣（アーイシャ）の家来だった。そいつが唸るとお前たちはそれに応え、そいつが傷つくとお前たちは逃げたのだ。』[2]といい、アーイシャ自身にも『なんとかという女（アーイシャ）はといえば、女特有の思考に捕らわれており、彼女の胸のうちには鍛冶屋の大釜のように悪意が燃え滾っているのだ。』[3]と言及したエピソードが知られている。
女性に関するもの
『人々よ、女は信仰においても欠陥があり、相続においても欠陥があり、知性においても欠陥がある。女の信仰に欠陥があるというのは、女が月経の間、礼拝と断食を行わないからである。女の知性に欠陥があるというのは、女二人の証人は、男一人の証人と同じだからである。（コーラン第2章282節[4]）女の相続に欠陥があるというのは、女の相続が男の半分だからである。（コーラン第4章11節[5]）[6]
『女に助言を求めるな。なぜなら、女の思考力は愚鈍であり、決断力は脆弱だからである。お前のヒジャーブによって女たちの目を覆え。なぜなら、厳しく隔てることで彼女たちを守ることができるからである。女を外に出すことは、信用できない男を彼女の所へ行かせる事と同じくらい悪い。彼女がお前以外の誰も知らないようにできるのであれば、そうせよ。女を自分自身以外のことに関わらせるな。なぜなら女とはメボウキの花（かぐわしいもの）であって、管理者ではないからである。必要以上に女を尊重するな。他人に干渉しようなどという考えを女に起こさせるな。それから、嫉妬する場所を間違えるな。なぜなら、それによって正しい女性が邪悪になり、貞淑な女性が疑わしくなってしまうからである。』[7]
『女とはそのすべてが邪悪なものである。しかし、その中でも悪いのは、人は女なしではやっていけないということだ。』[8]
その他
彼のみがスンナ派（スンニ派）、シーア派の両方から公認されたただ一人の指導者である。そのため、イラン・イラク戦争では、スンナ派のイラク兵はアリーの肖像を「お守り代わり」に持っていたといわれる（シーア派のイラン人も「アリーの肖像」には銃口を向けられない。そのうえ、スンナ派自身の信仰にも反しない）。
スンナ派のハディース集「真正集」（ブハーリー著）「遠征（al-Magh?z?）の書」のブライダ・イブン・アル＝フサイブの伝によると、ヤマン（イェメン）への遠征の際、預言者ムハンマドはアリーを前線司令官であるハーリド・イブン＝アル＝ワリードのもとに戦利品の五分の一を受け取らせるため派遣したが、ブライダ・イブン・アル＝フサイブの取り分であった捕虜女性（当時のアラブの慣習として、兵士は割り当てに応じてこのような女性を強姦して自分のものにする権利があった）をアリーが横取りし犯したという。