コミックスには主にジャンプに連載した作品が収録されている。ただし、全て連載順に収録されているわけではなく、諸般の事情により収録順が差し替わるか、次巻に持ち越され、あるいは表現の問題から収録されない話が出ることがある。
第1巻の第1話が「始末書の両さんの巻」となっているが、これは連載前の読み切り作品で、雑誌掲載時にはサブタイトルはなく、コミック収録の際に新しく付けられたものである。
第4巻の第1話「派出所自慢の巻」が1992年頃の自主規制で削除され、差し替える形で『こちら葛飾区亀有公園前派出所 下町奮戦記』描き下ろし作品「野球狂の男の巻」が巻末に収録された。
第1巻から第6巻までは、旧ペンネームの「山止たつひこ」名義で出版された版が存在し、これらの単行本の希少価値が高い。なお、ペンネームの変更に合わせて巻末の解説に使用されている「山止先生」「ミスターヤマドメ」などの言葉が「秋本先生」「ミスターアキモト」などに変更され、一部、文が変更されている。
1巻から44巻の作者紹介は、初期は実際の写真だったが、45巻からはイラストに変わり、1から44巻の写真もイラストに差し替えられている。なお、141巻は初期単行本のデザインを再現した装丁のため、唯一、作者紹介に作者の写真（ただし白黒の後姿）が使用されている。これと同時にカバーのタイトル・巻数表示・裏表紙のバックの部分の色の濃さなどが変更されている巻がある。
巻数サブタイトル背表紙初版発行日（奥付）巻末コメント
1早うち両さん!?の巻両津勘吉1977年7月9日小林よしのり
2敵もさるもの!!の巻両津勘吉（2回目）1977年9月30日五十嵐夕紀
3消えた派出所!?の巻両津勘吉（3回目）1977年11月30日太田裕美
4亀有大合唱!?の巻両津勘吉（4回目）1978年2月28日せんだみつお
5取りしまり日よりの巻両津勘吉（5回目）1978年5月31日アグネス・ラム
6亀有のダビンチの巻両津勘吉（6回目）1978年9月30日三遊亭楽太郎
7ラジコン決戦!の巻両津勘吉（7回目）1979年2月28日若人あきら
8アドリブ旅行…の巻両津勘吉（8回目）
秋本・カトリーヌ・麗子1979年6月15日桑江知子
9アイドル・ポリスの巻両津勘吉（9回目）1979年9月15日内藤陳
10部長代行の日!?の巻両津勘吉（10回目）1979年12月15日車田正美
11麗子巡査登場の巻両津勘吉（11回目）1980年2月15日中島みゆき
12ギャンブル狂時代の巻両津勘吉（12回目）1980年4月15日あらんどろん
13拳銃無宿!?の巻両津勘吉（13回目）1980年6月15日ツービート
14バイク男・本田!!の巻両津勘吉（14回目）1980年8月15日林家らぶ平
15ローラー大作戦!!の巻両津勘吉（15回目）1980年11月15日イエス玉川
16大和魂保存会!?の巻両津勘吉（16回目）1981年1月15日吉見佑子
17劇画刑事・星 逃田（ほし とうでん）!の巻両津勘吉（17回目）1981年4月15日小柳トム
18カメ型人間!の巻両津勘吉（18回目）1981年7月15日林家しん平
19ああ!忍車部隊の巻両津勘吉（19回目）1981年11月15日所ジョージ
20真夜中のパイロット!の巻両津勘吉（20回目）1982年1月15日水越けいこ
21本口リカ登場の巻両津勘吉（21回目）1982年4月15日香川登枝緒
22今夜は無礼講!!の巻両津勘吉（22回目）1982年7月15日矢代まさこ
23さらば!わが友よの巻両津勘吉（23回目）1982年9月15日吉田照美
24バーバーの恐怖の巻両津勘吉（24回目）1982年12月15日安田栗之助
25両津家の人びとの巻両津勘吉（25回目）1983年3月15日谷山浩子
26両津式貯蓄法!?の巻両津勘吉（26回目）1983年6月15日九十九一
27アメリカよいとこ!?の巻両津勘吉（27回目）1983年8月15日コンタロウ
28新雪之城変化!?の巻両津勘吉（28回目）1983年10月15日林家こぶ平
29ハローグッバイ!の巻両津勘吉（29回目）1983年12月15日桜金造
30親子水いらず!?の巻両津勘吉（30回目）1984年3月15日コント赤信号
31全日本パチプロ大会!の巻両津勘吉（31回目）1984年6月15日怪物ランド
32悪魔がやってきた!の巻両津勘吉（32回目）1984年9月15日鳥山明
33ターニング・ポイントの巻両津勘吉（33回目）1984年12月15日岸部シロー
34幹事の苦労!?の巻両津勘吉（34回目）1985年2月15日高千穂遥
35東京留学!?の巻両津勘吉（35回目）1985年5月15日荻野目洋子
36両さんの長崎旅行の巻両津勘吉（36回目）1985年8月15日新沢基栄
37結婚の条件の巻両津勘吉（37回目）1985年11月15日布川ゆうじ
38必殺正月カットの巻両津勘吉（38回目）1986年1月15日高田文夫