器官（きかん、organ）とは、生物のうち、動物や植物などの多細胞生物の体を構成する単位で、形態的に周囲と区別され、それ全体としてひとまとまりの機能を担うもののこと。生体内の構造の単位としては、多数の細胞が集まって組織を構成し、複数の組織が集まって器官を構成している。
細胞内にあって、細胞を構成する機能単位は、細胞小器官 （細胞内小器官、小器官、オルガネラ） を参照。
目次
1 植物の器官
2 動物の器官
3 動物の器官一覧
3.1 あ行
3.2 か行
3.3 さ行
3.4 た行
3.5 な行
3.6 は行
3.7 ま行
3.8 ら行
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動物の器官は、臓器（ぞうき）とも呼ばれる。内臓はより狭い概念で、体の内部に位置するものだけを指した呼び方。
同じような機能をもった器官や、全体として一連の機能を担う器官を、器官系としてまとめて考えることがある。一つの器官が複数の働きを持っているときには、複数の器官系に属することもある。器官系には、
消化器系 - 消化管
循環器系
呼吸器系 - 発声器官
泌尿器系
生殖器系
内分泌器系
感覚器系
神経系
運動器系 - 骨、関節、靭帯、筋肉
などがある。各記事には、それぞれに含まれる器官の一覧がある。
動物の器官一覧
下記は器官の一覧である。【 】内は、関連する器官系。
ただし、各記事は、動物種の記載が特にない場合には、ヒトの器官についての解説になっている。ヒトにない器官には、その器官を有する主な動物種を記載してある。
器官系ごとの器官の一覧は、上の各器官系の記事内にある。
あ行
アキレス腱（あきれすけん）【運動器】
胃（い）【消化器】
陰核（いんかく）【生殖器】
陰核亀頭（いんかくきとう）【生殖器】
陰茎（いんけい）【泌尿器】【生殖器】
陰唇（いんしん）【生殖器】
陰茎亀頭（いんけいきとう）【泌尿器】【生殖器】
咽頭（いんとう）【消化器】【呼吸器】【発声器官】
咽頭扁桃（いんとうへんとう）【循環器】→扁桃（へんとう）
陰嚢（いんのう）【生殖器】
陰門（いんもん）【生殖器】 ⇒ 陰裂
陰裂（いんれつ）【生殖器】
S状結腸（えすじょうけっちょう）【消化器】→大腸（だいちょう）
横隔膜（おうかくまく）【運動器】
横行結腸（おうこうけっちょう）【消化器】→大腸（だいちょう）
か行
回腸（かいちょう）【消化器】→小腸（しょうちょう）
下行結腸（かこうけっちょう）【消化器】→大腸（だいちょう）
下垂体（かすいたい）【内分泌器】
顎下腺（がっかせん）【消化器】→唾液腺（だえきせん）
眼球（がんきゅう）【感覚器】→目（め）
肝臓（かんぞう）【消化器】
気管（きかん）【呼吸器】
亀頭（きとう）【泌尿器】【生殖器】
橋（きょう）【神経系】
胸腺（きょうせん）【循環器】
筋肉（きんにく）【運動器】
空腸（くうちょう）【消化器】→小腸（しょうちょう）
口（くち）【消化器】【発声器官】