旧制医学専門学校（きゅうせいいがくせんもんがっこう）は、太平洋戦争前・中の旧学制における医師養成学校のひとつで、大学医学部や医科大学と違い、予備教育（旧制高等学校、大学予科）を経ないで旧制中学校卒業により入学し専門教育を受けた。
設立された時期の政策により左右されるが、修業年限は4ないし5年で臨床医の即時養成を主な目的とした。明治政府は当初、帝国大学以外に大学レベルの医学教育を認めなかったため、戦前よりの旧設医科大学の多くは医学専門学校として設立された。
大正時代になり大学令が公布され、国立（官立）では岡山医科大学（現・岡山大学）、新潟医科大学（現・新潟大学）、金沢医科大学（現・金沢大学）、長崎医科大学（現・長崎大学）、千葉医科大学（現・千葉大学）、熊本医科大学（現・熊本大学）、公立では京都府立医科大学、私立では東京慈恵会医科大学、日本医科大学が医科大学に昇格した。なお府立大阪医科大学（現・大阪大学）、官立名古屋医科大学（旧・県立愛知医科大学、現・名古屋大学）はさらに帝国大学へ昇格した。また、慶應義塾大学はこの時期に初めから大学医学部として設置されたため、私立のなかで唯一医学専門学校からの昇格ではない（ただし、明治の一時期に慶應医学校が開設されたが廃校となっている）。
その後しばらくは大学への昇格は無かったが、戦争直前に日本大学専門部医科が日本大学医学部に昇格している。戦中には医師速成の必要性から大学医学部や医科大学に附属の医学専門部を設置し医学専門学校と同等の教育をさせている。大学医学教育は男子に限られていたため、女子医学専門学校も設立されている。
戦後になり医学教育が大学に一本化されることになり、医学専門学校（大学医学専門部を含む）はGHQの審査によりA級校とB級校に選別され、A級校は旧制の医科大学に昇格し、学制改革により新制大学に移行した。A級判定されたのは45校で、うち44校が昇格した。
種別旧制医専旧制医大新制大学現在
国立青森医学専門学校弘前医科大学弘前大学
前橋医学専門学校前橋医科大学群馬大学
東京医学歯学専門学校東京医科歯科大学
松本医学専門学校松本医科大学信州大学
米子医学専門学校米子医科大学鳥取大学
徳島医学専門学校徳島医科大学[1]徳島大学
公立北海道立女子医学専門学校[2]札幌医科大学
福島県立女子医学専門学校福島県立医科大学
横浜市立医学専門学校横浜医科大学横浜市立大学
名古屋市立女子医学専門学校名古屋女子医科大学名古屋市立大学
三重県立医学専門学校三重県立医科大学三重県立大学三重大学[3]
岐阜県立女子医学専門学校岐阜県立医科大学岐阜医工科大学岐阜大学[3]
大阪市立医学専門学校大阪市立医科大学大阪市立大学
奈良県立医学専門学校奈良県立医科大学
和歌山県立医学専門学校和歌山県立医科大学
兵庫県立医学専門学校兵庫県立医科大学神戸医科大学神戸大学[3]
広島県立医学専門学校広島県立医科大学広島医科大学広島大学[3]
山口県立医学専門学校山口県立医科大学山口大学[3]
鹿児島県立医学専門学校県立鹿児島医科大学鹿児島県立大学鹿児島大学[3]
私立岩手医学専門学校岩手医科大学