全日本大学野球選手権大会（ぜんにっぽんだいがくやきゅうせんしゅけんたいかい、英語表記はAll Japan University Baseball Championship Series）は毎年6月に明治神宮野球場で開催されるトーナメントによる大学野球の選手権大会。主催は全日本大学野球連盟で、2004年からは読売新聞社と共催。
目次
1 大会概要
2 沿革
3 シードのシステム
4 歴代の記録
4.1 出場校と成績一覧
4.2 実績累計
4.2.1 学校別
4.2.2 所属連盟別
5 その他
5.1 応援について
5.1.1 応援リーダー台
5.1.2 楽器の使用
6 脚注
7 関連項目
8 外部リンク
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大会に出場できるのは全日本大学野球連盟によって加盟連盟としての承認が得られた各大学野球連盟の春季リーグ戦の優勝チームである。そのため、大学硬式野球におけるインター・カレッジ大会に位置づけられる。
秋季に開催される明治神宮野球大会（大学の部）と合わせて大学野球の2大全国大会の一つであり、年間を通しては大学球界の最上位タイトルになる。
1947年、東京六大学野球連盟、東都大学野球連盟、関西六大学野球連盟 (旧連盟)（以下、旧制大学3連盟）が設立した全国大学野球連盟が開催する大学野球王座決定戦が開催された。一方、第二次世界大戦後に発足した新制大学で構成された全国新制大学野球連盟は、大学野球界初の全国大会となる新制大学野球選手権を開始した。当初は旧制大学3連盟による全国大学野球連盟と全国新制大学野球連盟の間に全国組織の運営を巡って考え方の不一致があり、そのため、この時期の大学野球界は日本一決定戦が2つ併存する状況が発生していた。
その後の話し合いの結果、1952年には全国新制大学野球連盟を全国大学野球連盟に吸収する形で新しい全国大学野球連盟（当初は旧名称を継承したが2年目からは全日本大学野球連盟に改称）が発足。それに伴い全国大会も統一され全日本大学野球選手権大会が誕生した。
以上のような大会発足時の経緯から、当初は旧制大学3連盟のみが連盟単独の出場権を持っており、新制大学野球連盟から移行した他の連盟や所属チームは、各地域毎に地区代表決定戦を行なった上で本大会出場する形態となっていた。大会発足当時の出場枠は以下の通り。
東京六大学野球連盟
東都大学野球連盟
関西六大学野球連盟（旧関西六大学）
北海道・東北地区（後に北部地区大学野球連盟）
関東地区（後に甲信越を加えて東部地区大学野球連盟）
東海地区（後に北陸を加えて中部地区大学野球連盟）
近畿・中国・四国地区（後に西部地区大学野球連盟）
九州地区
なお、全日本大学野球連盟発足時の1952年1月の時点では、新制大学野球連盟側から移行した各地区連盟についてはまだ完全には整備されておらず、第一回の全日本大学野球選手権大会開催（同年8月）には参加校数の関係で一部不参加の地域があったり、後の地区名とは名称が異なったりしていた。
新制大学野球連盟から移行し、これら地区連盟内の内部に組み込まれたたものの中には、現存している連盟の前身や母体に繋がる連盟として既に結成されていた連盟もあるが、リーグ戦は代表決定戦と別に行なっていたり、リーグ戦自体は行なわずに代表決定戦の地域とりまとめを行なうだけであったりと、そのあり方については様々であった。（当時の詳細な情況が不鮮明な地区も多いが、各地区の情況については関連する各連盟の項を参照のこと。）
1965年には、東京新大学野球連盟（東部地区から独立）、関東五大学野球連盟（東部地区から独立）、首都大学野球連盟（東都からの脱退校により新結成）、愛知大学野球連盟（中部地区から独立）、九州六大学野球連盟（九州地区ら独立）の各大学連盟に出場権が与えられた。これは旧制大学3連盟以外への処置としては初めての単独出場権付与であり、実力的には未だ旧制大学3連盟には及ばないながら、大学野球の更なる普及振興の目的と共に新制大学野球連盟から移行した各大学野球連盟の実力が徐々にではあるが整ってきたことが認められた事に因る処置でもあった。
その後も地区内で結成された連盟に対して逐次出場権が与えられ、現在のような運営形態に発展していった。
なお、本大会出場の優秀選手や出場選手を中心として日米大学野球選手権大会の日本代表チームの構成メンバーが選出される。